五月甲寅，大赦。
桓冲闻秦攻凉州，遣淮南太守刘波泛舟淮、泗，欲挠秦以救凉。闻凉州败没，罢兵。
初，哀帝减田租，亩收二升。乙巳，除度田收租之制，王公以下，口税米三斛，蠲在役之身。移淮北于淮南。
二年七月丁未，以尚书仆射谢安为司徒，安让不拜；复加侍中，都督扬、豫、徐、兖、青五州诸军事。丙辰，荆州刺史桓豁卒。十月辛丑，以车骑将军桓冲代之。以五兵尚书王蕴都督江南诸军事，领徐州刺史；南郡相谢玄为兖州刺史，领广陵相，监江北诸军事。玄募骁勇之士，得彭城刘牢之等数人。以牢之为参军事，常领精锐为前锋，战无不捷，时号“北府兵”，敌人畏之。壬寅，护军将军、散骑常侍王彪之卒。
十二月，临海太守郗超卒。
三年正月，尚书仆射谢安以宫室朽坏，启作新宫，帝权出居会稽王第。二月乙巳，始作工，内外日役六千人。安与大匠毛安人决意修定，皆仰模玄象，体合辰极，并新制置省阁堂宇，名署太极殿。欠一梁，乃有梅木流至石津，津主启闻，取用之。又起朱雀门重楼，皆绣杨藻井，门开三道，上重名朱雀观。观下门上有两铜雀，县楣上刻为铜虎，左右对。
七月，新宫成，内外殿宇三千五百间。辛巳，帝入居之。
秦兖州刺史彭超攻沛郡太守戴逯于彭城，且曰：“愿遣重将攻淮南诸城，为征南棋劫之势，东西并进，丹阳不足平也!”秦王坚从之，使都督东讨诸军事。
八月，诏毛虎生率众五万以御彭超。
四年二月，兖州刺史谢玄帅众万余救彭城，军于泗口。彭超留辎重于留城，谢玄扬声遣后将军何谦向留城。超闻之，释彭城围，引兵还保辎重。戴逯帅彭城之众奔玄，超遂据彭城，留兖州治中徐褒守之，南攻盱眙。秦将俱难克淮阴，留邵保戍之。
三月，大疫。壬戌，诏以“疆场多虞，年谷不登，其供御所须，事从俭约。九亲供给，众官廪俸，权可减半。凡诸役费，自非军国事要，皆宜停省”。
秦毛当、王显自襄阳东会俱难、彭超攻淮南。五月，难，超拔盱眙，执高密内史毛璪之。秦兵六万围幽州刺史田洛于三阿，去广陵百里；朝廷大震，临江列戍，遣征虏将军谢石帅舟师屯涂中。毛安之等四万屯堂邑。秦毛当、毛盛帅二万袭堂邑，安之等惊溃。兖州刺史谢玄自广陵救三阿。丙子，难、超战败，退保盱眙。
六月戊子，玄与田洛率众五万进攻盱眙，难、超又败，退屯淮阴。玄遣何谦等乘潮而上，夜焚淮桥。邵保战死，难、超退屯淮北。玄与何谦，戴逯，田洛共追之，战于君川，复大破之。难、超北走，仅以身免。谢安还广陵，诏进号冠军将军，领徐州刺史。秦王坚闻之，大怒。
七月，槛车征超下廷尉，超自杀。难削爵为民。以毛当为徐州刺史，镇彭城；毛盛为兖州刺史，镇湖陆；王显为扬州刺史，镇下邳。谢安为宰相，秦人每入寇，边兵失利，安每镇之和静。其为政，举大纲，不为小察。时人比安于王导，而谓其文雅过之。
八月，以左将军王蕴为尚书仆射，顷之，迁丹阳尹。
五年正月乙巳，谒崇平陵。
夏四月，大旱，赦五岁刑以下。
五月，大水。朝廷以秦兵之退，为谢安、桓冲之功，拜安卫将军，与冲皆开府仪同三司。
六月甲子，以比岁荒俭，大赦，自太元三年以前逋租宿债皆蠲除之。
九月癸未，皇后王氏崩。
十一月乙酉，葬定皇后于隆平陵。
十二月，秦以左将军都贵为荆州刺史，镇彭城。
是岁，秦王坚遣高密太守毛躁之等二百余人来归。
六年正月，帝初奉佛法，立精舍于殿内，引诸沙门居之。尚书左承王雅表谏，不从。丁酉，以尚书谢石为仆射。初置督运御史官。
九月辛未，卫将军谢安初习水军于石头。
十月乙亥，故武陵王晞卒于新安。
是岁，江东大饥。
七年八月，大赦。东夷五国来贡。
是岁，梓潼太守周卒于秦之太原。信至，谢玄亲临哭之，因上疏曰：“旌表节义，国之典也。”帝悲之，追赠益州刺史。是岁，三吴士大夫置东冶为饯送之所。
八年三月丁巳，大赦。
八月甲子，秦王坚发长安，大举入寇，戎卒六十余万，骑二十七万，旌旗相望，前后千里。
九月，坚至项城，阳平公融兵三十万先至颍。又诏以尚书仆射谢石为征虏大将军、征讨大都督，以徐、兖二州刺史谢玄为前锋都督，与辅国将军谢琰、西中郎将桓伊共八万拒之；使龙骧将军胡彬以水军五千援寿阳。时秦兵既盛，都下震恐。谢玄入问计