书石星题：“淮扬一带河道，应修应筑，如总河潘季驯、勘科常居敬所议，添设镇河闸，接筑塔山缕堤、清河浦草坝，创筑宝应西堤，石砌邵伯湖堤，疏浚里河淤浅，增设柳浦湾料厂，此当在淮扬兴举者也。惟地里辽远，工程浩大，宜将郎中罗用敬等分地责成。御史不时稽察，而总河大臣仍亲自查阅。工坚可久者，从实奏报；推诿误事者，即时参处。”上是之。仍谕河工，着各照分定地方，用心管理，上紧完报，不许疏玩。
九月乙亥，升南京大理寺丞周希旦为应天府府丞。
十月甲申，工部复：“总督河道潘季驯条上河工八事：一、久任部臣。谓水性有顺逆，河情有分合，地势有险夷。如某处迎溜，作何卷筑，以当其冲；某处扫湾，作何帮护，以防其泄。事在分司，宜委任南、中两河郎中，满三考，方与优擢，则练习久而河防自然；一、责成长令。谓理河如理家，然家务繁琐，不妨分任，而庀材鸠工则家督主之。今濒河州、县长犹家督也，调集夫役，备办物料，宜专属之。至于巡行督率，责之行河者，而郡守亦有总理之责焉，疏虞则并坐；一、禁调官夫。谓治河有补偏救弊之法，无一劳永逸之事。禹奏平成，不数百年而祖乙之都圮，则防守弛也。故曰防河无止工。宜申饬沿河官夫，专以河为事，不得别差擅调，致误河防；一、预定工料。谓黄河泛涨，每在伏秋，修筑不预，往往为河所乘。宜于十月中旬，即行踏勘，分工备物，务令正月兴筑，四月报竣，后时者罚；一、立法增筑。谓徐、淮之间，咫尺河流，倚遥堤一线为捍蔽，而风雨剥蚀，车马蹂躏，日就卑薄。宜令每岁修堤，高厚俱以五寸为限。遇低薄处，随宜加筑，遍植樟柳。不如法者听总河官参治；一、添设堤官。谓高堰、柳浦湾二堤，绵亘二百余里，一大使往来防守，未免疏虞。宜另增柳浦湾大使一员，夫役即于高堰、南河数内拨出五百余名属之，以密堤防；一、加帮真土。谓淮水发源桐柏，挟七十二溪之水，经凤、泗入海。而基运山横截河中，涌涨时作，仅恃石堤一带为捍御。而石内之土，多系浮沙，一遇霖雨，辄至坍损，土既圮矣，石将安附。宜觅取真土，帮筑完固，以捍汹涌；一、接筑旧堤。谓清口乃淮、黄交会，而淮、黄原自不敌。然清口不至壅淤者，以王家口之堤筑，全淮皆从此出，其势足与黄敌也。自商贩盗决前堤，挖渠利涉，淮势渐分，将来清口必致淤阻。宜接筑长堤，就近责清河令监守，稍有疏虞，即行参治。”命依拟行。
十七年二月壬辰，流贼刘汝国未平，责令应天巡抚周继、提督操江王用汲等督率所属，协力剿捕。丙午，吴淞领兵指挥使陈懋功等与流贼刘汝国战，胜之。夺其大将军印及济贫王招贤纛，斩获二百余人。巡检汪焕获余孟新，哨官郎子机获刘汝国，余党悉平。巡按直隶乔璧星以闻。论功行赏有差，诛汝国、孟新。
三月辛亥，以淮、扬等被灾府、州、县万历十六年分起运本色米，每石改折银六钱，麦每石改折银四钱。壬子，工部以江南数郡屡遭水旱，未完四司料银等项银两，系十四、十五年者，常、镇二府每年带征二分，苏、松二府尤宜缓征。从之。乙卯，户部酌议：“应天抚、按及南京兵部侍郎王世贞疏言，浚导方兴，水利道不能兼摄粮储，粮储道亦不必另设，暂令苏、松兵备押运过江，免其过淮。”报可。
四月辛丑，复除原任广东按察司副使薛梦雷于浙江，整饬通、泰海防。
六月乙酉，升江西布政司左布政使陈文烛为应天府府尹。升顺天府府尹石应岳为南京都察院右副都御史，提督操江兼管巡江。
七月庚戌，大学士申时行等言：“近日，南京等处俱遭大旱，群情汹汹。且南京军士骄习成风，近因放粮之时，米色稍恶，几至激变。故今日所当亟处者，南京仓粮是已。宜敕南京户部将现在食粮盘验，足几年放支，是否俱堪食用？如有不堪，作何区处预备？至各处灾伤，宜俟勘到之日，复请优恤。”是日，上谕户部：“朕闻南京地方荒旱，军士贫苦。现在仓粮足支几年？如有不敷，作何处补？着南京户部会同科道查验计议具奏。其各处灾伤，候巡按御史勘到，从优议恤，务称朝廷悯念军民之意。”壬子，应天巡抚周继以人言再疏求罢，不许。
八月丙子朔，户部言：“旧例金花银一百万两，坐派苏、松、浙等处，每季分进二十五万两，此祖宗定例。至万历六年，奉旨每季加银五万两作买办应用，计每年增进银二十万两，原无坐派。今巳一十二载，计银已二百余万。乞念边饷为急，锡予为缓，每季买办银五万两，暂准停止。”不允。己卯，漕运总督舒应龙等条议漕务五事：“一、渡江期限。下江、浙江原有挑河银一万两，今则什不及一，以致苏、松一带，里河浅涸。宜每岁秋尽筑坝之时，尽行疏导，使漕艘得以及期渡江；一、分任委官。原差监兑主事，难以周历浙江，坐委府官巡行水次，下江四府，亦宜遴选府佐；一、量复徐淮仓。国初，俱民运至淮、徐、临、德四仓，以军船接运入京、通二仓。宣德以后，始兑拨附近卫所，名为兑运。国家两都并建，徐、