天府上元等县税粮有差。
十月甲子，革应天府及上元等五县管马通判、主簿，并马政于管粮官．革江淮巡检司。庚辰，以灾免应天、常、镇各府、州、县田粮如例，仍听折征兑军改兑南京仓米。
十二月丙子，升福建左布政使查约为应天府府尹。
九年二月壬申，更调总督漕运兼巡抚凤阳等处右副都御史毛思义及总理粮储兼巡抚应天等处右副都御史陈祥。初，祥为巡按直隶御史魏有本所劾。吏部言：“祥素有才望，虽督察似有苛细，而除贪祛弊，有益地方，舍短取长，不宜轻弃，请令祥与思义互调。”故有是命。甲申，吏科都给事中夏言言：“顷者，巡抚应天都御史陈祥劾奏苏州府同知徐州贪饕险坡，具有实迹，吏部已拟罢职。而巡按御史魏有本荐以为贤。及有本劾祥不职，而吏部盛称其才，不当轻弃，遂得调用。夫一徐州而抚、按之臧否悬殊，一陈祥而御史、吏部之毁誉迥别，陛下何所凭以为黜陟哉？臣窃谓州之贤否廉秽，不可不核其实；祥，有本之荐劾公私，不可不求其故，吏部之可否是非，不可不致其确。请下吏部、都察院核实以闻。”于是部、院复言：“祥扬历有声，抚吴有著。有本与之有隙，疏摭参奏，部初拟请改调，盖所以曲全言官之体。至于徐州赃污狼藉，抚臣持疏纠论。苏、歙密迩，岂有本独所未闻，实欲自异于祥，以致是非倒置，激扬之体夫岂宜哉！诚当核治。请解祥、有本任，回籍听抚、按官会勘，具实上奏。并请申饬天下抚、按，自今敢有私任喜怒，弹劾不实者，抵罪不宥；荐举非其人者，有罪必连坐之。”疏入。上以吏部右祥，责其不公。罢祥、有本，俱回籍听勘。丙戌，诏革应天府上元等县羊户。先是，巡抚都御史陈祥言：“南京光禄寺司牲司羊户凡二十六人，皆征银上元等县，不下三百余金。而岁办不过奉先殿荐新羊羔一只、司设监羊毛百斤耳。宜存句容、溧阳羊户各二人应役，余悉罢免。”从之。
三月甲寅，升山西右布政使江晓为应天府尹。
八月庚申，刑部复：“南京刑部主事萧樟所言三事：一、重民命。言凡南京五城兵马及各卫所所逮罪人，惟机密重大，关系地方者，乃关白内外守备，其争讼细故，则听巡城御史付法司案治；一、明律例。言《大明律》奥旨未易窥测，《问刑条例》类皆节去全文，意多未备。当责所司取近时颁布《律条疏议》及《律解附例》诸书，讲求参考，务求归一，然后请自圣裁，著之会典；一、清词讼。言诸曹各有职掌，其所司词讼，有当自理者，有当听法司理者，其事未竟，不当复诉他所，彼此牵制，以致事权不一，适资影射之计。”诏从之。甲子，以水灾，诏减应天府税粮有差。
九月乙未，以旱灾，诏免应天、苏州、松江等府秋粮有差。
十一月丁亥，命广宁伯刘泰提督操江。
十年二月甲戌，以水灾，免直隶淮安、扬州二府所属州、县并留守等卫、所秋粮有差。癸未，巡按直隶御史余勉学条陈江防二事：“一、饬武备以固江防。言留都所重，莫过江防。仪真而下，巡江军缺。卫不满四十人，所不满二十人，加以月粮不给，俯仰为累。乞敕兵部议处，将镇江卫原坐京操军士量留，以备江防，及行沿江卫分，凡巡江军缺，务足百名之上。应得月粮，务以时给，使其平居则常川操练，有警则互相应援；一、设营伍以据要害。言瓜州远在下流，与京口对峙。东控洋海，北接淮扬，甚为要害。虽有仪真守备往来巡历，然周岁不数至，其余奸细，何所踪迹。乞敕兵部议处，量于扬州卫调拨官军筑堡瓜州，常川守备，与仪真等处声势相接，以防不虞。仍行彼处量造衙宇，以便往来防守。”兵部复议：“拨军筑堡，难以轻议，余俱可行。”诏从之。
六月甲寅朔，先是，有旨令天下有司积谷备荒，视所积多寡，以为殿最。至是，巡抚应天都御史毛思义言：“应天府尹江晓等所积米谷，溢于原数；苏、松、常、镇等府知府聂豹等不及限，宜有旌别。”得旨：“晓等体国为民，分别等第旌举。豹等各守侥郡，反不及数，行政守己可知，其参究以闻。仍通行天下抚、按官查考，造册送部，以凭朝觐黜陟，勿事姑息。”丁巳，起户部尚书秦金为南京户部尚书。
闰六月戊申，裁革扬州府通判一员，海、邳、通、泰等州各判官一员，如皋、海门、砀山三县各县丞一员，宿迁、睢宁、安东、沭阳，赣榆、盐城、宝应、江都、兴化、泰兴十县各主簿一员，沭阳、沛县、及吕梁洪各税课局大使一员，高邮州仓、两淮运司马塘、莞渎、临洪三盐课司各副使一员，邳州、江都县各河泊所河泊一员，吕梁洪下闸闸官一员。改淮安府管马通判，山阳县管马主簿各—员为管河。
七月壬子，巡按苏、松等处御史胡体乾上言：“浙西诸郡，苏、松最居下流，即禹贡三江入海故迹。但今娄江、吴淞江已失故道。言者以为欲治水利，宜开二江，二江通则三江入海之故迹可复矣。至若苏州一府，以千里之地，纳诸路之水，东通大海，北通长江，其泄水也，有川。今