。朝廷从其请。继有书生吴志斗者，上言生长福建，熟知海道利病，以为若欲收附，且就澎湖发船往谕，相水势地利，然后兴兵未晚也。冬十月，乃命杨祥充宣抚使，给金符，吴志斗礼部员外郎，阮鉴兵部员外郎，并给银符，往使瑠求。诏曰：一收抚江南已十七年，海外诸番罔不臣属，唯瑠求迩在闽境，未曾归附，议者请即加兵。朕维祖宗立法：凡不庭之国，先遣使招谕，来则安堵如故；否则必致征讨。今止其兵，命杨祥、阮鉴往谕汝国，果能慕义来朝，存尔国祀，保尔黎蔗；若不效顺，自恃险阻，舟师奄及，恐贻后悔。尔其慎择之」！二十九年三月二十九日，自汀路尾澳舟行。至是日巳时，海洋中正东，望见有山长而低者，约去五十里。祥称是瑠求求国，鉴称不知的否。祥乘小舟至低山下，以其人众，不敢自上岸，命军官刘闰等二百余人，以小舟十一艘载军器，领三屿人陈辉者登岸。岸上人众不谙三屿人语，为其杀死者三人，遂还。四月二日至澎湖，祥责鉴、志斗已到瑠求文字，二人不从。明日，不见志斗踪迹，觅之无有也。先是志斗尝斥言祥生事要功，欲取富贵，其言诞妄难信。至是疑祥害之。祥顾称志斗初言琉球不可往，今祥巳至琉求而还，志斗惧罪逃去。志斗妻子诉于官。有旨发祥、鏖还福州置对，后遇赦，不竟其事。成宗大德元年，福建省平章政事高兴言：「今立省泉州，距瑠求为近，可伺其消息。或宜招宜伐，不必它调兵力，兴请就近试之」。九月，高兴遣省都镇抚张浩、福州新军万户张进赴瑠求国，擒生口一百三十余人而还』。是为中国再略台湾之事。当是时，澎湖居民日多，已有一千六百余人，贸易至者岁常数十艘，为泉外府。至元中，乃设巡检司，隶同安。澎湖之置吏行政自兹始。
明初宇内未平，桀惊之徒聚为海寇，出入澎湖，以掠沿海。洪武五年，信国公汤和经略海上，议徙澎民于近郭，以绝边患。廷议可之。二十年，遂废巡检，尽徙其人于漳、泉，而墟其地。自是澎湖遂为海寇巢窟。永乐中，太盬郑和舟下西洋，诸夷靡不贡献，独东番远避不至。东番者，台湾之番也。和恶之，率师入台。东番降服。家贻一铜铃，俾挂项间。其后人反宝之，富者至掇数枚。是为中国三略台湾之事。初，和入台，舟泊赤嵌，取水大井。赤嵌，番社名，为今台南府治，共井尚存。而凤山有三宝姜，居民食之疾瘳，云为郑和所遗。则和入台且至内地，或谓在大冈山也。嘉靖四十二年，海寇林道干乱，遁入台湾。都督俞大猷追之至海上，知水道纡曲，时哨鹿耳门以归，乃留偏师驻澎湖，寻罢之。居民又至，复设巡检；已亦废之。道干既居台湾，从者数百人，以兵劫土番，役之若奴。土番愤，议杀之。道干知其谋，乃夜袭杀番，以血衅舟，埋巨金于打鼓山，逸之大年。
万历二十年，日本伐朝鲜，沿海戒严。哨者谓有将侵淡水、鸡笼之议，明廷以澎湖密迩，议设兵戍险。二十五年，始设游兵，春冬汛守。于是澎湖复为中国版土。四十五年，日人入龙门港，遂有长戍之令。初，日本足利氏之末叶，政乱民穷，萨摩、肥前诸国之氓相聚为盗，驾八幡船，侵掠中国沿海，深入闽、浙，而以台湾为往来之地，居于打鼓山麓，名曰高砂，或曰高山国。高砂为日本播州海滨之地，白沙青松，其境相似，故名；或曰是番社之名也。当是时，日本征夷大将军丰臣秀吉既伐朝鲜，谋并台湾。二十一年十一月，命使者原田孙七郎至吕宋，途次赐书高山国，劝其入贡。书曰：『夫日轮所照临，虽至海岳、山川、草木、禽虫，莫不受他恩光也。予际欲处慈母胞胎之时，有瑞梦。其夜日光满室，室中如昼，诸人不胜惊愕。相士相聚占卜之，曰：「壮年辉德色于四海，发威光于万方之奇异也」。故不出十年之中，而诛不义，立有功，平定海内。异邦遐陬向风者，忽出乡国，远泛抢海，冠盖相望，结辙于道，争先而服从矣。朝鲜国者，自往代于本朝有牛耳盟，久背其约。况又予欲征大明之日，有反谋。此故命诸将伐之。国王出奔，国城付一炬也。闻信已急，大明出数十万援兵，虽及战斗，终依不得其利，来勒使于本邦肥之前州而乞降。徭之筑十个城营，收兵于朝鲜域中庆尚道，而履决真伪也。如南蛮琉球者，年年献土宜，海陆通舟车，而仰予德光。其国未入幕中，不进庭，罪弥天。虽然不知四方来享，分为其地疏志，故原田氏奉使命而发船。若是不来朝，可令诸将攻伐之。生长万物者日也，枯渴万物者亦日也。思之不具』！是为日本经略台湾之始。三十二年，山田长政赴暹罗，途次台湾。于时日本人在台日多，或采金于哆啰满，或寄居小琉球。既复攻鸡笼番，胁取其地。明朝忧之，乃增澎湖游兵。秀吉死，德川家康嗣大将军，戡平内乱，图远略，奖励海外贸易，其船之出洋者给朱印状以保护之。四十三年，村山等安受高砂渡航朱印状。等安，肥前人，奉景教，家康委以经略台湾之事。欲利用其教以收服土番，乃率其子来。家康以兵三千与之，欲取为附庸。然以无援，故不成。先是中山遣使于明日，日本有取台湾之议，明廷命警备沿海，及是而罢。
天启元年，海澄人颜思齐率其党入居台湾，郑芝龙附之；事在其传。于是漳、泉