庙前，今废（「县志」）。
康熙二十三年设立营制，陆续起盖墩台营房。嗣后凡遇损坏，例由协营移会澎粮厅估价造册请修。乾隆二年、五年俱被风雨刮坏，奉文酌拨闲款修葺，后来渐次倒坏。光绪三年五月，前协镇吴奇勳，择较场演武厅之东、旧武庙基址，起盖果毅军兵房二十八间、哨官房三间、官厅一座，用工料银一千七百七十一两三钱六分六厘。千总王建功督造。
水提、铜山、南澳、闽安四标，各有私馆，名为祀神。其制度宏敞奢丽。凡民间抬扛棺木过其馆者，戍兵必群起阻之，箠楚交下；或执缚同行人；故皆纡道避之，莫敢撄其锋者，积威约之渐也。各标又各有火房，标兵私建，均在妈宫大教场。一所在协署西偏演武厅二进。原建前进三间，乾隆三十三年、协镇许德增建后进三间，光绪三年协镇吴奇勳重修。
火药局，原在新城里，一座三间，官厅炮房各一座三间。嗣因倒坏，嘉庆二十二年移建大教场东，二座十间。光绪三年重修其火药库，在新城炮台地室内（详「海防考」「炮台」篇内）。
军装局，原在右营游击署后，内二进，共房六间。
兵制
内地各营应拨班兵旧制原额，共二千名，各分为四起轮戍，三年一换。乾隆四十七年，奉裁一百四十二名。又将金门标兵移戍安平。另拨海坛、南、铜各标兵以补其数。统计两营共一千八百五十八名，开列于左。
水提中营战兵四十五名，守兵三十九名。水提左营战兵四十六名，守兵三十九名。水提右营战兵四十七名，守兵三十八名。水提前营战兵四十八名，守兵三十八名。水提后营战兵四十六名，守兵三十八名。南澳左营战兵五十九名，守兵一百四十二名。铜山营战兵一百二十八名，守兵一百四十九名（以上拨戍澎左，军械俱全）。
海坛右营战兵一百八十四名，守兵二百六十九名。南澳左营战兵一百八十三名，守兵八十九名。铜山营战兵五十二名，守兵一百零二名。闽安右营守兵十名。烽火门守兵十四名（以上拨戍澎右，军械俱全）。
同治七年，举行裁兵加饷新章，台、澎一律办理。其换班旧制，计自道光二十九年以后，未经轮换。闰四月，奉台湾镇刘檄饬：台澎戍兵久未换班，其中事故缺额不少；仰即查明，该营应行换班戍兵共有若干？其单身无家，情愿归应革退者若干？其单身无家情愿归者若干？每兵积欠旧饷，按数量为减给，资遣内渡。嗣经水师提督李，檄行内地各标营分拨戍兵，配全军械，到澎轮换。所有实存额数，开具如左（据同治八年营册）。
水提中营战兵十六名，守兵十六名。水提左营战兵二十名，守兵十六名。水提右营战兵二十名，守兵十七名。水提前营战兵二十名，守兵二十三名。水提后营战兵十三名，守兵二十四名。南澳左营战兵二十三名，守兵六十二名（又降战为守九名）。铜山营战兵四十九名，守兵七十五名（以上拨戍澎湖左营，前于定制九百二十八名内，奉新裁存外，额战守兵共五百零六名。兹比照司单改议留营兵数，又裁去八十一名。总共提、南、铜三标外额战守兵四百零二名。又存舵工、炊兵十七名。另新加稿识三名、字识十一名、号令手三名）。
海坛右营战兵五十九名，守兵一百十三名。南澳左营战兵六十六名，守兵三十六名。铜山营战兵十九名，守兵五十二名。闽安右营守兵四名。烽火门守兵六名（以上换戍澎湖右营，前于定制九百二十八名之内，奉新章裁存外，额战守兵共五百零五名。兹比照司单，又裁去一百二十三名。总共海、南、铜、闽、烽等营外额战守兵三百六十名。又存舵工、炊兵十六名。另加稿识一名、字识三名、号令手一名）。
谨按：雍正五年，奉上谕：『嗣后班兵生事不法者，或经发觉、或被驻台官员叅出，将派往之该管官一并议处』。雍正六年定制：凡换往台、澎兵丁军器，动帑制造，务必坚利精良。该督抚验看给发。又定议：内地各营派拨更换之时，必令一营之兵分散数处，不令彼此相联络。又屡降恩旨，加给班兵饷米，并原籍眷属胥沾实惠，亦既约束坚明，体恤备至矣。自咸丰间，闽省水、陆营兵积欠银米甚多，始以铁钱给发，继以永丰官局票银搭给。迨局票已不可行，仍以半银半票陆续酌给；而朋扣及胥吏使费，必不可少；于是每兵一名，月饷仅得二、三百文钱，而营制不胜其病矣。但内地营兵各有业可执，尚安之若素；而台、澎戍兵，全赖饷银糊口，不得不分外取求，聚党生事；不特本官不敢问，即澎之文员，亦因积欠加饷米票而大为所挟矣。同治五年，爵督左公以练营兵丁不能收一战之效，因兵冗饷薄所致，建议裁兵加饷，就饷练兵。至七年间，各营裁撤四、五成，而加饷倍数。澎湖两营额名二千名，屡经裁撤，至是仅存七百余名。然澎湖岛屿环列，汛地甚多，配汛配船、出差领饷之外，所余无几，尤不敷调派。故论者谓闽省兵饷之制，自国初至今，相承二百余年；施侯尝率之以平台、澎矣，间如台湾朱一贵、林爽文、陈辨、海寇蔡牵之徒，屡次倡乱，皆以水师平之；其时银米足给，故兵皆训练可用也。若依前银数，每月实支实给，或裁其二、三成之兵，即以其饷银匀贴该营