使。乙丑，谕曾国藩等禁商船济贼。丁卯，乔松年为江宁布政使。许道身办江南北粮台。谕都兴阿等抚循北渡难民。
四月丁丑朔，麟庆等奏请饬各省将额运及采办米石迅速运京。乙未，谕曾国藩接济僧格林沁军饷。庚子，粤逆犯镇江。癸卯，程学启等军复昆山、新阳。甲辰，豁江苏新复州县本年漕粮。是月，豁免江苏太仓等八州县额赋。
五月壬子，粤逆、捻匪合犯天长，官军击败之。谕都兴阿严防窜越里下河。乙丑，谕曾国藩进规江浦、九洑洲。曾国荃拔雨花台伪城及聚宝门石垒（此据奉上谕月日，求阙斋弟子记在四月二十五日）。戊辰，总理各国事务衙门奏酌定购置轮船节制章程。谕：此项轮船归曾国藩、李鸿章节制。己巳，以江苏苏州、松江、太仓三属被贼茶毒，地方凋废，谕曾国藩等将粮额折中议减。壬申，彭玉麟等军复江浦、浦口及九洑洲。
六月戊寅，诏曾国藩议减江苏常、镇两属漕粮。癸巳，李鸿章奏克吴江、震泽。
七月丁未，程学启克太湖贼垒，进薄苏州。丙辰，命李鸿章在上海商办荷兰国换约事宜。丁已，谕李鸿章商令英、法、美各领事禁洋船济贼。壬戌，允李鸿章奏，江北漕米仍收折色。乙丑，谕各省学政：如有经明行修之士，许酌保数人以为乡里矜式。务当认真察考，不准视为常例，滥行保奏。
八月辛巳，命总兵陈国瑞帮办漕运总督吴棠军务。甲申，都兴阿奏：教匪盛广大勾通粤逆，诛之。谕山东、山西、河南限一月内各拨解陈国瑞军饷三万两。丙戌，江苏官军克江阴。曾国荃军克江东桥。庚寅，程学启会戈登克苏州宝带桥。辛卯，谕都兴阿妥筹济渡江南难民。李鸿章赴江阴督剿。辛丑，荷兰换约。癸卯，收复无锡，李鸿章等军击李秀成等，大破之。
九月戊申，允李鸿章请，调在籍江西知县丁日昌赴沪督制火器。己酉，曾国荃军克淳化镇等要隘。庚戌，朱善张为淮徐扬海道。乙丑，允李鸿章请，靖江县仍归常州府辖。丙寅，允都兴阿奏，酌设渡口，济渡难民。
十月丁酉，李鸿章奏：程学启等军攻克浒墅关，进逼苏州省城阊门。李鸿章赴娄门督剿。谕李鸿章妥办苏州绅士捐租助饷。庚子，谕冯子材军进取丹阳。癸卯，逆酋李秀成援苏州，李鸿章军击败之。
十一月丁未，李鸿章督程学启各军克复苏州省城，逆酋郜云官等降。丙辰，李鸿章诛郜云官等，遣散降众。丁巳，李鸿章克无锡、金匮。戊辰，谕各省督抚巡查新复地方逆产及无主荒地，安插难民、降众。庚午，江苏官军复浙江平湖，贼目以乍浦、嘉善降。辛未，李鸿章奏：移驻苏州，兼筹上海。
十二月甲戌，贼目以海盐降苏州官军。李鸿章奏复平湖、乍浦、海盐各城。庚辰，江苏官军克平望。辛巳，万启琛为江宁布政使，接办粮台。刘郇膏为江苏布政使。郭柏荫为江苏按察使。甲午，允江苏松江、太仓等处漕粮减价折征。
三年正月甲辰，李鸿章督军击常州援贼于奔牛镇，大捷，奔牛解围。丙午，以捐输军饷，广江苏兴化县学额四名。辛未，以捐输军饷，广江苏清河学额三名。是月，减免江苏高邮二十三州县被水，被旱暨折色银两，泰州等二十八州厅县暨淮安等四卫被旱，被兵新旧额赋租课，太仓等三十三州厅县，苏州等五卫被扰旧欠额赋漕粮。
二月，李鸿章奏克宜兴、荆溪。辛卯，李鸿章奏复溧阳。
三月辛酉，拨户部银五十万两充曾国藩军饷。
四月辛未朔，官军击丹阳援贼，败之。丁丑，鲍超各军收复．金坛。戊寅，增设江宁驻防协领二，佐领、防御各四，经制、笔帖式各三。甲申，李鸿章督军克复常州府城。冯子材等军复丹阳。丁酉，总署奏：饬火器营拣派弁兵赴江苏学习火器。裁江防下游师船。是月，豁免江苏武进、阳湖二县三年额赋，蠲缓上元等十三县及各屯卫被扰上年额赋。
五月己酉，广江苏盐城县学额七名、高邮州三名。李鸿章奏：汰留常胜军，撤遣外国兵官。谕以原任提督程学启所部之军驻上海。庚戌，丁日昌为苏松太道。扎克丹为江苏苏州遗缺知府。戊辰，遣京兵赶上海学治火器。命李恒嵩、刘郇膏与丹使壁勒在上海换约。
六月辛未，允冯子材请，遣散镇江防兵四千名。癸酉，复江苏高淳东坝等城隘。丁丑，江苏官军复浙江长兴。庚寅，曾国荃军克金陵外城。乙未，谕曾国荃迅克金陵内城。戊戌，官军复江宁省城。（此据奉上谕之日，求阙斋弟子记十六日，国荃攻克金陵时，逆首洪秀全自裁，其子福瑱遁，逆酋洪仁达、李秀成均就擒，江南平。）
七月辛丑，以江南新复地方凋弊，谕各省抚慎选守令，招徕抚恤。甲辰，申谕乔松年移扎正阳关合剿。丁未，允富明阿裁撤师船。己酉，诏遣曾国荃致祭明太祖陵。申谕曾国藩等裁江北厘捐，并兴复两淮鹾务。壬子，谕曾国藩回驻江宁，筹办善后，简汰兵勇。逆酋洪仁达、李秀成伏诛。辛酉，豁江苏