南镇江咽喉重地，因无建牙重臣整饬战具，以致贼兵内犯。查旧制，设文武操江二员，今止存操江巡抚一员，又驻八百里外，鞭长不及，恐误事机。合请移驻京口，专防江海。吴淞要地，仍责令苏州总兵官镇守。无事，则训练水师；有事，则飞舸追剿。职守既定，南北各无推诿，海氛扑灭，可计日待矣。”下所司速议。壬申，周国佐奏：败寇张名振于崇明南沙嘴、寿兴沙等处，焚获贼船甚多。甲戌，以冯如京为江南右布政使。丙戌，命江宁昂邦章京管效忠移驻镇江，苏州提督张天禄移镇吴淞，总兵官王燝移镇刘河。
五月丁未，遣刑部郎中刘世杰往江南恤刑。
六月庚辰，苏州、常州、松江、镇江等府飓风海溢，房屋树木半被漂没倾拔，男妇溺死无算。
八月庚午，谕吏部：“朕览江宁巡抚周国佐历来章奏，词语模糊，意见游移，此必事事假手左右，胸中漫无主持。苏、松重地，岂容阘茸之人因循贻误！周国佐着解任回旗，该部 会推才品堪任者具奏。”甲戌，以张中元为右佥都御史，巡抚江宁。
九月丁未，江南、江西总督马国柱以衰老休致。庚戌，改江南、江北提督学院为提学道。辛亥，降漕运总督沈文奎三级凋用，以督催漕运稽迟也。
十月辛未，免江南淮、扬二府、徐州被灾额赋。
十一月庚戌，以余应魁为江南按察使。
十二月辛巳，漕运总督沈文奎疏报：招垦江北荒屯地九千九百余顷，征银二万一千有奇。
六月甲寅，以孔允樾巡按苏、松。庚申，严禁沿海省分，无许片帆入海，违者立置重典。己巳，裁江南操捕、管屯都司各一员。
七月乙酉，给事中季开生奏：“近日臣之家人自通州来，遇吏部郎中张九徵回籍，其船几被使者封去。据称奉旨往扬州买女子，恐奉使者不能仰体宸衷，借端强买，小民无知，未免惊慌，必将有嫁娶非时，骨肉析离之惨；且乘机而奸棍挟仇捏报、官牙垄利挪移诸弊，断不能无。乞皇上速收成命。”得旨：“前内官监具奏，乾清官告成在即，需用陈设器皿等项，合往南省买办，故令发库银遣人往买，初无买女子之事。太祖、太宗制度，宫中从无汉女，且朕素奉皇太后慈训，岂敢妄行。即天下大平之后尚且不为，何况今日，朕虽不德，每思效法贤圣之主，朝夕焦劳，屡次下诏求言，上书禁勿称圣，惟恐所行有失。若买女子入官，成何如主耶？季开生身为言官，果忠心为主，当言国家正务实事，何得以家人所闻、茫无的据之事，不行确访，辄妄捏渎奏？肆诬沽直，甚属可恶！着革职，从重议罪具奏。”寻部议：应杖一百，折赎流徒尚阳堡。从之。壬辰，遣刘士杰往江南恤刑。
八月壬申，降苏松提督张天禄职三级，以贼入汛地、伤兵焚船故也。癸酉，降总督马鸣珮职二级，夺江宁巡抚张中元俸，以海寇登岸焚掠，不据实入告，徇庇失事提督张天禄，以罪为功也。
九月戊子，复设江南福山、杨舍、江阴、靖江、孟河、永生各营及沿江汛兵共一千八百名。
十月戊辰，谕江南督抚：督率所属各粮道恪奉漕规，冬兑春开，务依限到淮，勿得拖欠稽迟。辛未，复设总理漕务满洲侍郎一员，驻扎淮安。庚辰，添设江南黄浦参将一员，水陆官兵八百名。
十一月甲申，以吴库理为户部右侍郎，总理漕务。戊申，裁淮安府东新仓大使一员。
十二月甲子，以许宸为江南按察使。乙丑，增松江府水利通判一员。癸酉，初，海寇犯淘港，士卒被伤并抛失军器甚多，至是，革江南提督张天禄职。甲戌，以秦世祯为操江巡抚。
十三年正月已酉，革苏州总兵官王璟职，以海寇侵犯汛地，不能戮力戡定故也。
二月已未，分江南华亭县为两邑，旧邑名华亭，新邑名娄县。乙丑，江宁巡抚张中元保举隐逸故明进士陆贻吉、于沚。下所司议。辛未，裁江南兴屯道同知。
闰五月己酉，江南、江西总督马鸣珮以病免。戊午，遣刘宗韩巡按江宁，李森先迅按苏、松。己未，以郎廷佐为江南、江西总督。
六月辛卯，转陈培桢为江南左布政使。癸巳，敕谕江南各省督、抚、镇等官曰：“朕惟自古帝王底定万邦，皆恩威并用，讨贰怀服，乃能使人心乐于归往，早享太平。本朝开创之初，睿王摄政，攻下江、浙、闽、广等处，未降者多被诛戮，以致遐方士民，疑畏窜匿。从海逆郑成功者，实繁有徒，或系啸聚有年，未经归化；或系被贼迫胁，反正无由；或系偶陷贼中，力难自拔，原其本念，未必甘心从逆。此辈皆朕赤子，迷罔无知，深可悯侧。今欲大开生路，许其自新。该督、抚、镇即广出榜文晓谕，如贼中伪官人等，有能悔过投诚，带领船只、兵丁、家口来归者，察照数目，分别破格升擢。更能设计擒斩郑成功等贼渠来献者，首功封为高爵，次第亦加世职，同来有功人等，显官封赏，皆所不惜。倘仍执迷不悟，郑