。起郝杰为南京工部尚书。
九月己丑，差御史蒋汝瑚巡按应天。
十月癸亥，诏今岁南京及各省俱照例暂免行刑。辛未，迁徐州砀山县城于秦家塘地方。
十一月癸巳，以灾伤免萧县等县本色钱粮。
二十七年正月戊子，两淮税监鲁保奏：“有私贩匿课盐商孟养志等，乞重加罚治。两淮盐课正股之外，乞许行存积盐引，岁进银十二万两。”从之。庚寅，南京句容等十五县灾。户部复议，灾重者改征折色有差，轻者仍征本色；其米、豆、芝麻等项，供祀陵庙之用，不得改折。报可。丁酉，遣内官高寀征税于京口闸，暨禄征税于仪真。听千户郑一麟、百户马承恩之奏也。
二月辛未，户部题复：“应天抚、按揭借各项银两，以充段价。其已借支万历十年绢布等银，准其开销。其二十五、六年草、米、盐钞等银，照数征解。袍价不敷，另行设处，毋亏正供。”上从之。
三月丙午，应天巡抚陈惟芝上言：“太湖夙称多盗，而湖之西北隶常州府，汊港错杂，乌溪、定化、兰溪三港，尤群盗出没之薮也。先年，虽用木桩钉塞，顾日久弊生，奸民往往昏夜私开。臣等议于港口狭处，筑堤砌石，中开水窦，仍用排钉，防其出入。惟是奸盗趋险如鹜，非得明旨严法振肃之，不已也。请如山东南旺等处禁例，盗决者，为首之人，民则充近卫，军则调极边。载入河防勒石，永为遵守。仍责成附近巡司，不时稽察，此弭盗安民之第一议也。”章下工部复，行之。
四月丙寅，户部开具直隶苏、松等府节年金花逋银共百万有奇，乞差官守催。从之。丁卯，诏两淮引盐，已纳官课，仪真税监不得重征。从鲁保请也。
闰四月丙戌，仪真税监暨禄委官马承恩等，以抽税激变。禄耸词具奏，且参守御杨应光推诿不救。上命逮应光究治。已获犯人陈真等，送南京刑部重拟；未获者，严限缉拿。仍申饬抚、按及地方有司，毋得各分彼此。应光已逮，禄复为乞原，诏释之。
五月丁巳，改南京右都御史赵焕为南京吏部尚书。庚午，调左通政徐申为应天府丞。
六月壬辰，户部复：“南京国子监祭酒郭正域议，比因司成、主簿等官钱谷不习，付之书役，致存侵欺。议将该监钱粮置立通知文簿，分发府厅协管，互相稽查。其师生全廪、半廪银数，明白开载，照单发给。已未代领及有无短少，俱令亲注缴查。至于派征椒油、馔肉等银，要照在监诸生实数行派。仍行文上、江两县，每季总解簿厅，以防私受。房园租银各给佃户印票，亲赴交纳，不许书役私受，以滋干没。官、恩、举、贡入监，即与支粮，新附坐班一年，酌量给廪。俱查照会典开载事例遵行，仍着为令。”报可。丁未，榷采肆出，江南纷扰。应天巡抚陈惟芝乞停矿税，疏六上，不报。至是，绘图孝陵风水争之。疏曰：“东南财赋重区，民劳而鱼赭，臣抚兹三载，忧深杼轴。近大江南北，所在开凿。臣初惧貂挡横恣，以厉民也。及相山川形势，匪特厉民，并以厉国。锺阜紫金山，高皇帝卧弓剑之地，二百余年，王气锺焉，山之祖也。其牛渚、石柱、龙眠、瓜步绵亘五六百里，皆紫金之枝也，枝凿则伤根。谨恭绘孝陵风水图，细注源流。”上览图，即日报罢。
九月己酉，工部言：顷南京鸿胪寺卿张朝瑞与臣一魁奏议治河得失，意见各别。科臣桂有根看详，谓在臣以治祖陵之水，而决意于分黄导淮，兼为运道民生之计，在朝瑞目击萧、砀、宿迁之患，而遂欲塞堌复徐、邳，而未深为陵寝、淮、泗之图。顾天下之事，旁观者不若当局之为审。今日河工，固有重臣在也，安可任盈廷之议，以启纷争。乞敕下河臣勘明具奏。业奉明旨允行，惟是朝瑞与臣一魁原疏俱留中，恐河臣无从勘核，乞简发二疏，以便遵行。上命据各揭帖转行查勘。竟从一魁议。
十月甲申，南京国子监祭酒郭正域条议申饬监规：一曰、广搜额，以罗异材。大略谓时文不足以尽才，科目不足以得士。请下礼部，访求各州、县九流异学之士，稍如宋司马光十科例，或善推步，或诸钟律，或通阵法，或工六书，各为一科。府、州、县贡入礼部考核，分别等第，选入两京国子监。得照选贡事例，次者依旧附事例，与之全廪，一体拨选。如异日太常诸属之选，则取诸乐律科；钦天诸属之选，则取诸历象科；殿阁中书之选，取诸六书科；幕府参赞之选，取诸兵法科。则平日养之有素，而一旦求之，如探囊而取物矣；一曰、严差拨，以杜请托。南壅诸差，祖制惟有小刷历与湖差耳。后乃创立市书、问安名目，借差自便。又举人以超拨为分内，一拨之外，又超一拨，非法也。臣已出示严革二差，请著为令；一曰、申禁罚锾，以一赏罚。太学之中，所恃为赏罚者，止压班耳。不知何年许压班监生输银自赎。夫法贵一也，令贵平也，令无力者走班，而有力者输银，非平也。臣已出示严革，请著为令；一曰、勤课诵，以修职业。按太学仪节，举贡不背书，非制也。臣请科贡诸生，自本经之外，别兼一经