报至，举朝震惊，命削彩职，戴罪图功。廷麟、元吉退守赣州，清兵追攻之。
五月竞渡，郑芝龙率标营官军于西湖斗舟，旗帜皆写「钦命藩王」等目。
琉球国入贡。廷试贡生，取万刑等十二人，命为萃士，照庶吉士例送翰林院教习。擢湖广监军道章旷为右佥都御史，巡抚湖北。鲁监国遣都督陈谦入闽，久驻衢州持两端，自云鲁已爵为侯，却邀封。召赴行在，御史钱邦芑劾其外媾，下狱，将杀之。芝龙与谦有旧，亟入朝，请以官赎谦死；王故留芝龙久语，密促行刑。芝龙出，已死矣，因厚殓之；由是益怀异志。加吏部尚书郭维经六省督师衔，募兵援赣。赣已被围两月，巡抚刘广胤战败受执，援兵皆不敢前。
六月，开科取士。命广额七十名，流寓者皆入试。以编修刘以修、闵肃为主考，举叶琐等一百七十五名。士子多以贿进，乃命于至公堂覆试，落四名；逮同考推官王三俊下狱，追赃一万两。浙东报至，清兵已渡江取绍兴，鲁监国航海去，江上诸师尽溃。鸿逵驻城外，闻报，乃徒跣而逃，三日抵浦城。事闻，行在大震，削其封爵（以上南疆绎史、小腆纪年、榕城纪闻）。
鲁王航海入闽，十二月次中左所，寻改次长垣。
兵部尚书东阁大学士田仰奔闽，封海忠伯；寻迎降。
兵部尚书兼东阁大学士督师防江熊汝霖随扈鲁王入闽（以上残明宰辅年表）。
七月，元子生，大赦；加恩从兴诸臣，悉进爵。御史钱邦芑言：『浙东新破，唇亡齿寒，举朝正切同仇之日，非蒙恩受赏时也』。不报。己已，王御门，内侍捧小匣置御前，诏谕群臣曰：『朕本无利天下心，以勋辅拥戴，不得已勉徇群策，浣衣粝食，有何人君之乐？干夕干惕，恐负重付。岂意诸臣已变初志！昨巡闽之使，得尔等出关迎降书二百余封，今俱在此。朕不欲知其姓名也，今命锦衣卫焚之午门前。尔诸臣其有名者，尚洗心涤虑否？倘能竭节奉公，不渝终始，是所望也』！王长身丰颐，声如洪钟，闻者悚息。时决计幸赣，芝龙百计阻之，欲留王以自重；既而阴通款于洪承畴，托言海寇至，驰还临安，尽撤关隘，水陆诸兵随之去。清兵既破浙东，长驱而前，仙霞岭空无一卒，遂如入无人之境焉。何腾蚊遣郝永忠以铁骑五千迎驾，将至韶州，清兵已出衢州矣。初，杨文骢走处州，唐王与之有旧，拜为兵部侍郎，提督军务；至是援衢，清兵至，不能御，为追骑所获，不降，戮死（南疆绎史、通鉴辑览）。
八月甲申，清兵克建宁，明兵备佥事倪懋熹死之（小腆纪年）。
甲午，王启行。监军钱邦芑先期请清路，犹赫赫颐指属县。乙未，驾至行宫，戎冠金蟒而入。上好书，虽崎岖军旅，犹载书数十车以从。丁酉，上抵顺昌，昧爽未发，至巳刻，一时排闼，云清兵已及剑津，毁关，且踵至。顷之，行宫数骑突出，云驾已在内，从行者惟何吾驺、郭维经、朱继祚。已而何与郭亦散去。曾后肩舆河干，顾从官曰：『刘宫人有怀，好护持就道』；辞旨慷慨。妃媵狂奔，有一舸而数人者，有一骑而三人者。先是清兵抵仙霞关，守浦城巡按御史郑为虹纵民出走，自守空城，与治饷兵科给事黄大鹏、延平知府王士和并被执，死之。至是，王自延平出奔。庚子，入汀州城。辛丑，清兵奄至，有叩城称扈跸者；开丽春门纳之，则追者八十三骑也。守门百户闵时死之，骑直入行宫，从官迸散，乃执王与曾妃去。总兵福清伯周之藩战死。妃至九龙潭投水死，沈嫔、陈嫔及内官死者十余人。王死于福州（三藩纪事本末、小腆纪年作王与曾妃同斩于汀州之府堂）。其殉难之臣有唐王聿钊与弟聿■〈金粤〉、部郎赖垓、给事中熊纬、御营总兵胡上琛、定远侯邓文昌等。或曰代死者为张致远，王实未死；后郑成功兵屯鼓浪屿，有遣使存问诸臣者云为僧于五指山，然亦莫必其真伪也。是冬十月，赣州闻王讣，全城气索。会天雾雨雪，城夜破，督师大学士兵部尚书杨廷麟、户部尚书姜一洪、兵部侍郎左副都御史江广总督万元吉俱赴水死，吏部尚书郭维经、御史姚奇胤入嵯峨寺自焚死，湖西兵备佥事太常卿彭期生自缢死，兵部职方主事周瑚被执不屈戮之，右都御史杨文荐擒至南昌绝粒死，翰林院编修徐复仪投崖死。后闻难继死者：尚书曹学佺、通政使马思礼等皆自缢，御史艾南英缢于汀州僧舍，大学士蒋德璟于九月泉州失守不食死。粤中永明王立，遥上尊号曰思文皇帝。丁酉春，复谥曰绍宗襄皇帝（闽事纪略、南疆绎史、清白士集、临汀汇考、小腆纪年、恽逊庵遗集）。
时大学士何吾驺走广州，十二月迎降。大学士曾樱、路振飞走居中左所。大学士黄景昉走泉州。大学士朱继祚走兴化。吕大器奔广东。熊开元为僧。太仆寺少卿王瑞枬避山中，有欲荐令出者，自经死。振飞后赴桂王召，卒于途。都督胡献深与其妾衣冠对坐，饮药于私第。有赵昂者不肯薙发，从容刎死于家。先是阮大铖赴江干乞降，从清兵攻仙霞关，僵朴石上死。马士英既降，清兵至顺昌，搜龙扛得士英等请唐王出关己为内应疏，遂斩之延平城下（明纪、残明宰辅年表）。