又谕：柴大纪婪索金银五、六万之多，且豫行寄信家中，属伊子先行防备。见据琅玕在其屋后地平之下，起出金锭银两；可见柴大纪勒索所属、剥削兵民，贪婪激变种种款迹，已确凿可据。
三月癸亥朔谕：柴大纪前在嘉义县防守，未经带兵出城一节，经福康安等查明，防守嘉义县俱系义民之力，其未经出城亦系义民不肯将伊放出，伊亦畏贼不肯带兵出城。柴大纪前次所奏，全不足信。是柴大纪恇怯无用，又复狡展欺饰，并守城亦无寸功足录矣。
谕；台湾获盗，无论首从，皆按律正法。俟五年后，再照旧例分别奏请（以上东华录）。
泉州各庄，赐褒忠、旌义里名；漳州各庄，赐名恩义村（瞥记）。
四月谕：台湾逆匪滋事，其始不过无藉匪徒，邀集伙党，倡立会名，尚无聚众谋逆之事；前年闽省办理杨光勋械斗夺犯一案，该省文武各员惟思将就完结，并未将逃逸匪犯实力缉拏。又柴大纪贪纵营私，永福近在同城，又有奏事之责，并不参奏，亦未据实揭报。该省督抚、该道于堵御贼匪固为出力，但核其贻误地方之罪，究属功不掩过。永福着革职，送交刑部治罪；臬司李永祺于覆审时不即严切根究，殊属徇纵，着一并革职，留于台湾效力赎罪；该抚徐嗣曾平时漫无觉察，并着交部严加议处。
五月，福康安等奏：台湾改建城垣，用砖既难拉运，用石尤易矬蛰；请筑土城，高一丈八尺为率。除南北东三面依照旧基外，惟西面一带濒海应收进一百五十余丈：共添建城楼八座、卡房十六座、兵房八座。至凤山县城偪近龟山之麓，地势低洼，请移于十五埤头街地方，仍用刺竹围插；其旧城基址与彰化县西八卦山，均应添设石卡一座，驻兵防守。
癸酉谕：前因台湾戍守兵丁，向内地各营分拨前往，远涉海洋，纷纷更调，且义民出力者甚多；是以谕令即在台湾募补，以归简便。今据福康安等体察舆情，若先尽义民挑补，既恐未谙军纪、不能得力，又恐招募漳、泉之人太多；请于内地征兵内详加挑选，照依戍兵额缺，令其顶补，自属实在情形。其熟番既可招募，并请将集集埔等处空余田地拨给番民，自行耕种；仿照屯田之例，将壮健熟番挑作屯丁，设立屯弁管束，自应如此办理。至台湾无藉游民不安本分，武断一方，名为罗汉脚；此等恶习最为可恶，与四川■〈口固〉噜匪犯无异。见经大加惩创之后，不可不实力查拏，务使不复有此项名目，方为妥善。
六月谕：福康安等奏称，向来台湾各营，自总兵至守备衙门，皆有兵丁听候差遣，分为旗牌、伴当、内丁、管班四项名目，各有目兵管领；总兵署内多至三百人，副将以至守备依次递减，至少亦有三十余人。请嗣后将四项名目全行禁革。从之。
又谕：前将万锺杰补放台湾道时，特令加按察使衔，原欲令该员遇有应奏事宜，得以自行陈奏。嗣后遇有补放台湾道员者，俱着加按察使衔，俾得自行奏事。
七月谕：柴大纪在台湾总兵任内，任意废弛营伍，纵容兵丁赃私累万盈千。迨贼匪窃发，并不实时带兵亲往扑灭；复托词回城调兵，迁延时日，以致酿成贼势。及收复嘉义县城时，又不并力追剿，与贼以暇，致贼人复得占踞斗六门、大里杙等处，修筑抵御。种种贻误军机，经福康安等定拟斩决，解京办理。朕以柴大纪情罪重大，本应立正典刑；其在嘉义奏称不忍以十数万生灵委之贼手、情愿固守之处，虽查系义民不肯放出、皆属谎词，朕究念其尚有守城微劳，欲俟解到覆讯后，加恩从宽末减，改为监候。兹据军机大臣等覆讯，柴大纪复思狡展，翻供低赖，岂可复从宽典？柴大纪着照所拟，即行处斩，以为昧良狡诈退缩者戒！
十月谕：据徐嗣曾奏，柴大纪所奏正法及戮尸各犯内有许怀等三十五名本系误拏，经知县陈良翼审属良民，据保释放；柴大纪必欲回护原奏，按名正法。争执再三，复令该县扶同捏报，始准释放。是柴大纪妄奏冒功，几令无辜良民数十人陷于重辟，情节尤为可恶。着将柴大纪之子查明发往伊犁，给与兵丁为奴，以示惩儆。
五十五年（一七九○）三月，免福建台湾府属应征供粟，其官庄租息银免十分之三。
十一月，徐嗣曾卒，调浦霖为福建巡抚（以上东华录）。
五十七年（一七九二）六月，台湾地大震（东溟文后集）。
六十年（一七九五）三月甲子，台湾匪民陈周全作乱，陷鹿港。乙丑，攻彰化，陷之。先是二月，南路凤山匪民陈光爱谋反，攻石井汛，未破被获，斩其党数十人，众溃，事且定矣，捕少懈。已而内地米贵，商船争集；台米亦贵，石米钱五千文。北路彰化游民聚众抢夺，知府遇昌，右营游击陈大恩驰往，擒治十数人，晓谕彰鹿有榖之家出粜，市价平。三月，遇昌回郡，大恩留彰化弹压，陈周全遂为乱。周全，同安人，生长台湾。乾隆五十七年回籍，与同安匪民苏叶谋反未成，事败逃至凤山，与陈光爱结会；再败，逃至彰化湖仔庄泉州人马江家，复与潮州人陈容（郎陈光辉）、漳州人黄朝、黄亲分漳、