杨昌浚奏言：『福建岛屿林立，海道险恶，筹防之难；甲于他省。而台湾孤立重洋，物产丰腴，久为各国所窥伺。此次法祸之起，独趋福建，先毁马尾舟师，以断应援之路；继则肉薄基隆，分陷澎湖，无非为吞全台之计。仰仗天威，越南大捷，法人悔祸请和，台湾危而复安。使孤拔不死，固未尝一日忘也。从前丁日昌在台创议各事，实为至要之图，惜未及成而去。今防务已松，善后万不可缓。而省城兼顾不及，应否请派重臣驻台督办？中国海面辽阔，在在须防；请划水师为三路。北洋设于津沽，兼顾奉东各口；中洋设于吴淞，兼顾浙江定镇；南洋设于台澎，兼顾广东琼廉。分布要害，声恩相通，外侮之来，庶几克济』。部议以南、北两洋既设海军，若台澎新置水师，需费巨大，应须他日；故铭传有志亦未逮也。
初，台湾分巡道未有兵权，但率练勇，以理盐政。及道光四年十月，始加营务处，颁给督办军务关防，得以调度戎机，奏行赏罚，然大权仍在总兵。十二年，铬传设营务总处于台北，隶巡抚，以道员卢本扬任之。中南各路设营务处，节制军事。又设支应局，隶布政使司，理粮饷。其时分驻各营，北路为定海四营，基隆为铭字四营，中路为栋字三营，南路为练勇四营，后山为镇海八营，澎湖为宏字四营。各具洋式军械，而绿营渐废矣。十三年十月，铭传奏言：『台湾绿营，额设水师七营，陆师十一营，共兵一万四千余名。自同治八年，前督臣左宗棠奏准裁兵加饷，存兵七千七百余名。迨光绪三年，前抚臣丁日昌复奏请汰弱留强，暂停募补。至光绪八年，经台湾镇总兵吴光亮核明以故续裁，实存兵数四千五百余名，年支饷银十七万余两。此后如有革故，随时募补。是为水、陆现存兵额』。是月二十日，户部咨开：『闽省现在裁减水、陆额兵一成，以节饷需。台湾绿营兵额，能否照裁，应由台湾巡抚酌度情形，迅速议覆』。铭传奏言：『台湾地方辽阔，额设兵丁历次裁减，仅存四千五百余名。现在改为行省，分治开山，拓地日广，设汛益多，不足分布。以今观之，实不能再行裁减』。从之。
法军之役，设转运局于上海，以输饷械，而台湾孤悬海上，一旦封港，航运莫至，则坐而待毙。淡水素产硝磺，可制火药。是年设军械机器局于台北，以记名提督刘朝干为总办，聘德人彼得兰为工师，自制枪弹，供军用。又设火药局于大隆洞、水雷营于基隆沪尾。南北各口增筑炮台，训练炮兵。计费二百一十余万两。夫铭传之治台，不独办防、练兵已也，造铁路以通之，行邮船以辅之，振殖产以裕之，辟财源以以养之，改内政以新之，设教育以明之，使民能知义，国无患贫，而兵乃可用。夫兵者所以禁暴保大、定功安民、和众丰财者也；故以战则克，以守则固，以攻则破，节制之师也。台湾之虽未及此，而铭传能整饬之，以防御外侮，亦可用也。
○郑氏武官表
正总督：永历三十二年设，以左武卫刘国轩任之，表赐尚方剑，专征伐。
副总督：永历三十二年设，以后提督吴淑任之。
勇卫
侍卫
左武卫
右武卫
左虎卫
右虎卫
正提督
副提督
中提督
前提督
后提督
左提督
右提督
五军都督
中军都督
督理戎政
五军戎政
旗鼓中军
总练使
行军司马
咨议参军
参军
监纪推官
材官
正总兵
副总兵
参将
游击
都司
守备
千总
把总
○郑氏各将军表
左龙骧将军：永历三十五年，以郑明任之。
右龙骧将军：永历三十五年，以郑智任之。
征北将军：永历三十二年，以刘国轩任之。
平北将军：永历三十七年，以曾瑞任之。
定北将军：永历三十七年，以王顺任之。
平西将军：永历二十九年，以吴淑任之。
宁南将军：永历三十一年，以刘进忠任之。
安东将军：永历二十九年，以刘炎任之。
荡虏将军：永历二十八年，以张学尧任之。
殄虏将军：永历二十八年，以马应龙任之。
破虏将军：永历二十八年，以武弘谟任之。
平虏将军：永历二十八年，以吴淑任之。
征虏将军：永历三十年，以张国勋任之