为易冶。是故子产治郑，孔明治蜀，莫不用严。况台湾为新创之地，非严无以治军，非严无以统众，唯在制宜而已』。三月，以洪开、祁辟等十人管社事。命诸将各移眷入台。南澳镇陈豹不从，讨之，以杜辉留守。
初，罗马神父李科罗在厦传教，成功礼之，延为幕客。当是时，华人之在吕宋者数十万人，久遭西人苛待。诸将议取吕宋为外府。成功使李科罗至马尼拉，说吕宋总督入贡，而阴檄华侨起事，将以舟师援之。事泄，西人戒严，集兵马尼拉，毁城裂砦，以防窃踞。而华人已起矣，鏖战数日夜，终不敌，死者数万人。或驾小舟至台湾，多溺死。成功抚之，而吕宋仍俶扰，又虑郑师往讨，乃命使者随李科罗乞和。诸将欲问罪，未出师，而成功病革矣。
成功有子十人。世子经年十九，居厦门，与乳媪通、生子以闻。成功大怒，令董昱、洪有鼎至厦，谕郑泰监杀经及董夫人，以教子不严也。诸部大惊。又闻成功病，谋保全之。谓经子也，不可拒父，诸部臣也，不可拒君；唯泰于成功为兄行，谓兄可拒弟，乃杀乳媪及儿以报。成功不肯，解佩剑与昱命再至厦。适周全斌自南澳回，亦奉命。诸将诱执之。夏五月初八日，成功病革，尚登台望海。乃冠带，请太祖训出，坐胡床，命左右进酒，折阅二帙，叹曰：『吾有何面目见先帝于地下哉』！遂薨于路寝，年三十有九。台人以其弟袭为护理。十四日，讣至，经嗣位，发丧，修表达行在。闻袭将为东都主，经骇然。乃出全斌为五军都督，陈永华为咨议参军，冯锡范为侍卫，整师欲东。秋七月，清靖南王耿继茂、闽浙总督李率泰遣人来讲，经不从。泰等请经。经曰：『吾将东，诸君善图之』。议照朝鲜事例，派中军都督杨来嘉答之。不报。来嘉还。以忠振伯洪旭、永安侯黄廷辅泰守厦门，并论铜山、南澳诸将，毋废战守。冬十月，经至澎湖，历巡各岛，乃赴台。黄昭、萧拱宸谋拒经，陈师海澨，为全斌所杀。众倒戈，经免胄示之。黄安大呼曰：『此吾君之子也，其速往迎』！经遂入王城。袭入见，复为叔侄如初。十一月，率全斌巡视南北二路，镇抚诸番。
十七年春正月，滇城讣至，经犹奉朔称永历。以统领颜望忠守安平，勇卫黄安镇承天，提调南北军务。率全斌、永华、锡范至厦门。以泰潜结黄昭、萧拱宸等谋抗拒，事露，夏六月，置酒邀泰，缢杀之。泰子缵绪、弟鸣骏亡归清。冬十月，继茂、率泰调投诚诸军台荷兰出泉州，提督冯得功出同安，降将施琅、黄梧出漳州，分道并进。经部署诸将，令全斌御之。十九日，会于金门鸟沙港。荷兰夹板十余舟，巍巨如山，泉舟三百，箕张而下。全斌以艨艟二十艘，往来奋击，剽疾如马；荷人发炮无一中者。清军见之，■〈目咢〉眙相视，云翔而不敢下。得功殿，为全斌所殪。已而耿、李各济师，琅、梧亦至。郑师不敌，退守铜山。清军入金、厦，堕两城，弃其地，收宝货妇女而还。两岛之民烂焉。
十八年春正月，援剿右镇林顺降清。二月，南澳护卫左镇杜辉亦降清。洪旭言曰：『金、厦新破，铜山难守，不如退保东都，以待后图』。经从之。命永华、锡范扈董夫人先行。宗室宁靖王、泸溪王、巴东王、鲁王世子暨乡绅王忠孝、辜朝荐、卢若腾、沈佺期、郭贞一、李茂春悉扁舟从。至澎湖，与旭历视诸岛。旭曰：『澎湖为台湾门户，上通江浙，下达南洋，必须建设重镇，以固海疆。若澎湖有失，则台湾无所措手足』。乃建垒妈宫，左右峙各筑炮台，烟火相望，令薛进思、戴捷、林升等守之。初，全斌奉檄与黄廷殿，而与洪旭有宿嫌，迟疑不往，遂降清。廷亦受黄梧之诱。经既入台，委政永华。永华善治国，与民休息。八月，改东都为东宁，天兴、万年为二州。划府治为四坊，坊置签首理民事；制鄙为三十四里，置乡长，行乡治之制。东宁初建，制度简陋，乃教民烧瓦，建宫室衙署。礼待避乱搢绅。凡诸宗室，皆赡给之。分诸土地，又行寓兵于农之法，台湾以安。初，荷人既丧台湾，谋恢复，居于鸡笼。成功命黄安逐之。既去，遂会清人攻两岛。及金、厦平，徙民入界，而率泰亦班师。六月，荷将波尔德入福州，与清军盟，议伐台，率泰以两蓬船援之。然台湾防守固，不易取，乃率舟北上，次普陀山，遇飓覆没。及是而罢。九月，英人来求互市，许之。十二月，北路土番阿狗让乱，命勇卫黄安平之。
十九年春正月朔，经率文武贺帝于安平镇。闻施琅疏请攻台，集诸将计议。洪旭曰：『前者，荷人失守，恃其炮火，冯其港道，而不防备澎湖，故我先王一鼓而下。夫澎湖为东宁门户，无澎湖是无东宁也。今宜建筑安平炮台，以炮船十艘防守鹿耳，别遣一将镇澎湖，严军固垒，以待其来，则敌不易渡也』。经曰：『善』。以杨祥守鹿耳门。颜望忠请自赴澎湖，经抚其背曰：『得公一行，吾无忧矣』。命旭调屯田军十分之三，益以勇卫侍卫各半旅，合万余人，分配炮船二十艘，乌船赶缯各十艘，以戴捷、薛进思、林升、林应等率之。又虑北鄙空虚，命刘国轩以一旅守鸡笼，何佑以一旅守大汕头。
三月，望忠至澎湖，驻军妈宫，左右峙各修炮台，以戴捷、