察，不得日久生懈、滋弊生事』。
二十二日（癸未），谕曰：『常青于柴大纪贪黩不法一案徇隐不奏，前曾降旨将伊革职，交福康安审讯。经福康安奏明审讯录供，令伊来京交部治罪，固属咎由自取；但念常青由将军简用总督，在任未久即值台湾逆匪滋事，非富勒浑、雅德历任年久、因循贻误、讳饰袒庇者可比。其到台湾后，于柴大纪种种劣迹固易访查，但彼时正值办理军务匆迫，其不即查参亦属可原；且伊年逾七旬，带兵驻守郡城保护无虞，其功过尚可相抵。常青着加恩免其交刑部治罪；俟到京后，候朕酌量加恩，另降谕旨。朕办理庶务一秉至公，罪之轻重固视其人之自取；而于功过相抵之处亦必斟酌其平，不肯稍有畸轻畸重。即编户小民尚不使一夫冤抑，何况封疆大吏转不为之经意乎！富勒浑、雅德亦当惭服并自知悔惧也。将此通谕知之』。
谕军机大臣等：『适询自闽回京大臣官员，据称「当林爽文攻扰台湾时，漳、泉人欲为内应」；此必系伊同教一党。现已将林爽文、庄大田生擒，贼众尽行歼灭；不特台湾安堵，即漳、泉匪徒当亦胆裂。今固难于追究，然不暗为防范，苟且因循，久之有如林爽文者出，则又多一事矣。但地方官每多捏饰，遇有此等匪徒，始则容隐；及至发觉，又不能奋勉任事。必须该管上司不动声色，实心查办，庶可剿除净尽。李侍尧事务练达，意见周详；着密行传谕该督悉心防范，逐渐翦除，方为妥善』。
二十三日（甲申），谕军机大臣等：『各省地方官建立生祠，非违道干誉、即倚势力贿求，最为陋习；必应饬禁。此次特令建立建勋诸臣之生祠，乃因台湾地隔重洋、民风剽悍，逆匪等纠众滋事、肆行不法，福康安等带兵前往剿捕，未及三月即已擒渠蒇事。该处民人经此一番惩创，暂知敛戢；第恐日久复忘，是以许在彼建立福康安等生祠，明示武威，使之怵目儆心，望而生惕。此为绥靖海隅，因地制宜起见。但福康安办理善后各事宜完竣即须回京，且伊亦无自办生祠之理，自应该督等承办；何以未据李侍尧、徐嗣曾奏及？着再传谕该督等止须遵照前旨，于台湾郡城、嘉义县两处建立生祠。至此次带兵大臣内，惟福康安、海兰察、鄂辉、普尔普、舒亮功绩较着，职分亦大，应行入祠；祠内设立木牌，书写伊五人官阶。其余各员威望俱轻，未便一体列入。徐嗣曾现在台湾，此事即交与该抚妥办。从前该省耿藩肆逆时，范承谟效忠殉节，曾饬建祠宇，非同创设；该抚可仿照办理』。
闽浙总督李侍尧奏：『拏获张破脸狗，供有广东大埔县人赵明德、陈丕、陈栋至福建诏安县云霄地方劝令入会，现已飞咨两广督臣孙士毅查缉』。得旨：『天地会究系起自广东传至福建，张破脸狗供出之赵明德等三犯为首，先在闽传教之人；着孙士毅即速饬属严密查拏，按名务获，勿任免脱漏网』。
二十九日（庚寅），谕：『据福康安、徐嗣曾奏「审讯骫法营私之革职总兵柴大纪及有心徇隐之道员永福分别定拟」并「请将得受陋规及逢迎馈送之文武员弁分别革职治罪」各折，已交军机大臣会同大学士九卿法司核议具奏矣。台湾地隔重洋，文武各员自应各矢洁清，力图整顿；乃不肖员弁竟敢需索陋规、废弛营伍，甚至纵令兵丁等包赌窝娼、从中染指，以致酿成巨案。此而不严加惩创，何以儆官邪而靖海疆！至柴大纪身系台湾总兵，于每次出巡时不但令各营伍备办供给，且折收夫价银两，赃私累累。国家设给养廉，于大员特加丰厚，原以备伊等因公之用；若巡阅营伍时，仍须该管弁兵代办夫马饮食一切，则内地之督、抚、学政、提、镇于出巡按试时，途次夫马等项亦必令地方官代为置办，又安用优给养廉为耶！嗣后督、抚、提、镇及学政等凡遇巡查、出考，途次所需夫马等项，均着自行备用，毋得令经过各员代办。并令文武互相纠察，如有仍前需索扰累者，即各行据实参奏，从重治罪；如或徇隐不奏，别经发觉，朕亦必将徇隐之员一并治罪，决不姑贷，勿谓朕不教不诫也。将此通谕知之』。
谕军机大臣曰：『徐嗣曾系本省巡抚在任有年，武职营伍尚可委之总督，而文职内有收受陋规、营私贪黩等弊，即应随时查访，据实参奏；非如福康安系特旨简派发往台湾专办剿捕逆匪者可比。总督李侍尧到任未久，随驻札厦门料理一切军务，未暇查办及此；魁麟亦系新任将军：徐嗣曾皆非其比。乃徐嗣曾竟若忘其自为巡抚，置身局外耶！其于杨廷理收受陋规之事，平日既漫无觉察，不行查参；经福康安彻底查奏，又复腼颜一同列衔而折内竟无一语引咎之处，殊不可解。着徐嗣曾将因何不早行参奏及会衔具奏又不自引咎之处，明白回奏』。
钦差协办大学士陕甘总督办理将军事务公福康安奏：『熟番募补屯丁事宜：一、全郡熟番九十三社，约可挑壮丁四千名。请分为大屯四处、每屯安设四百人，小屯八处、每屯安设三百人，作为额缺；即令在本社防守。户小之社或数村归并，或附入大社。其立屯之地应酌量地势，按照番社多寡，与营汛官兵声息联络。一、屯弁照四川屯练之例，南、北两路额设屯千总二员，统领番众；屯把总