传筹商防务，勤加操练，增高墙垒、深浚沟濠，以期有备无患』。报闻。
二十五日（癸亥），钦差大臣督办福建军务左宗棠奏：『法将孤拔，已于四月十九日在澎湖病毙。所有「平安」轮船被虏之干军弁勇，应另与法官商办，俾得早日收回』。报闻。
又奏：『衰病增剧，现在中、法和约已定，请开缺回籍调理』。得旨：『览奏殊深廑系。着赏假一月，安心调理；毋庸开缺』。
二十六日（甲子），谕〔军机大臣等〕：『杨岳斌等奏「筹办台湾防务」：「澎湖、基隆、沪尾三海口，均须长泊快兵船一只；修造炮台运办各料，须装货船二只。请饬南、北洋分拨快船三只、福建船政速拨货船二只，到台备用」等语。台湾所需各船，能否照数拨往？着李鸿章、曾国荃、裴荫森奏明办理。至各船到台之后，饟项如何发给？并着妥议具奏。将此由四百里谕知李鸿章、曾国荃，并传谕裴荫森知之』。
又谕：『据岑毓英电奏：「云军三万余人已撤回二万三千余人，均抵开化、临安边界；留粤勇七千余在后弹压，陆续撤回」等语。法人现已退出基隆，专俟滇军及刘永福营一律撤回，即将澎湖退出。着岑毓英懔遵迭次谕旨，迅将关外滇军全数撤回边界，不得稍涉迁延；并饬催刘永福赶紧督率所部入关，毋任逗遛。仍将抵关日期，飞速驰奏。前据李鸿章电奏：「据教士报称云南拏获法兵四、五名，在营囚系，请饬交还」等语。并着岑毓英查明所获法兵，妥为交还。将此由六百里谕令知之』。
福建巡抚刘铭传奏：奸商吞匿厘金、道员通同作弊，已将台澎道刘璈撤任查办。得旨：『刘璈着即撤任，听候查办』。
又奏：『基隆一隅自遭兵祸，民房焚毁无余，田地荒芜，流离可悯！拟请抚恤，由淡水捐输项下拨款动用』。如所请行。
以任情勒捐，革台湾宜兰县知县王家驹职。
——以上见「大清德宗景皇帝实录」卷二百八。
六月初三日（庚午），谕内阁：『杨岳斌、刘铭传、孙开华奏「台北解严，请将历次战守尤为出力将弁官绅及筹运出力人员奖励」各折片，刘铭传驻守台北，未能相机决策攻复基隆，本属无功足录；而各营将弁官绅，固守要隘历时甚久，迭次接仗亦能竭力抵御，自不能因督师之不力，并没行间效命之劳。惟所请奖叙，未免过优；量行核减，酌予恩施。王诗正、沈应奎均系已革司、道大员，左宗棠并未先行奏明辄令赴营，本不应给予奖叙；姑念该革员等业经渡台，不无微劳足录。王诗正着赏给五品顶戴，沈应奎着赏给四品顶戴；阵亡之总兵曾照礼、副将刘义高等均着交部照阵亡例，从优议恤』。
谕军机大臣等：『已革游击吕文经，前经降旨发往军台。嗣据杨岳斌奏请留营，复经谕令即行起解，不准逗遛；迄今已逾两月，未据奏报起程，殊属延玩！着杨昌浚、刘铭传、张兆栋迅即派员将吕文经赶紧起解，不准藉词迁延；并着将起解日期，先行奏闻。将此由四百里各谕令知之』。
以台北战守出力，予提督苏得胜、郎中林朝栋等升赏衔翎有差。
初四日（辛未），谕军机大臣等：『岑毓英奏「行抵云南边界并檄令关外各营一律撤回」一折，张之洞迭次电信多系传闻之误。该督现已檄令关外各营一律撤回，越地不留一兵，以昭信义；所办甚是。现在基隆法兵已退，所有被虏弁兵悉数收回；法兵之留澎湖者，其意专候滇军及刘永福一军全数撤回后，方能照约全退。着岑毓英督催各军迅撤，刘永福所部进关后，仍速饬前赴思钦一带驻索，毋再迁延；一面将各军进关日期先行驰奏。越民之情殷内附者，编列民籍；如果相安，即着遵照前次电旨，妥筹安抚。将此由六百里谕令知之』。
初十日（丁丑），谕内阁：『鸿胪寺卿邓承修奏：「福建布政使沈葆靖被参闻警移眷出署一款，疆臣、部臣未能据实定议」等语。左宗棠等查办此案，语涉疑似；吏部议覆沈葆靖处分，亦属从轻：均有不合。左宗棠、杨昌浚着交部议处；吏部承办此案堂司各官，着查取职名，交该衙门议处。并着吏部将该藩司应得处分，另行复议具奏。沈葆靖着即开缺来京，听候部议』。寻吏部奏：遵旨改议处分。得旨：『前福建布政使沈葆靖着照部议降三级调用，大学士左宗棠、闽浙总督杨昌浚着照部议降一级留任，均不准抵销』。
十一日（戊寅），调广西布政使张梦元为福建布政使。
十二日（己卯），谕军机大臣等：『电寄张之洞：据电奏「法教入粤，流弊太多，示弱太甚」等语。传教载在条约，上年七月降旨用兵，尚谕令保护法国教民。现在基隆已退，被虏弁兵均已收回；法使业已到京，教士照约入口，有何示弱？澎湖尚未退出，正以滇省撤兵稍迟为借口；若再因阻教入粤别添枝节，以致澎湖久居不退，其为示弱不更甚耶？此等紧要关键，岂能轻听僚属、将弁之言，有意阻格。如地方莠民藉端滋闹，全在该督严饬弹压；果能实力奉行，何至生事？贺璧理致法领事信，有「法教入粤、粤督不愿」