旨交查知府李彤恩并饬讯道员朱守谟一案，请另派大员查办』。得旨：『现在和约已定，防务解严；该前督何得避嫌取巧，托词推诿！仍着杨岳斌秉公查办，据实参奏，不准稍涉偏徇』。
初九日（丁未），谕〔军机大臣等〕：『电寄杨岳斌等：据李鸿章电称「法兵于初九日准退出基隆」等语。上年刘铭传仓猝赴台，尚称勇往；自基隆失事，未能迅复，咎实难解。现在法人已退，着责成杨岳斌、刘铭传、孙开华将全台应办事宜，实力布置；如有疏懈，惟该前督等是问』。
蠲免福建省光绪五年以前积欠钱粮。
十一日（己酉），谕军机大臣等：『近闻刘璈有禀请洋款办理台南善后之事；本日已有旨，电饬左宗棠等不准擅发。左宗棠到闽后，每于调人差委，未经奏明辄行派往；殊属非是。嗣后遇有用人拨款等事，务当先行奏报，候旨遵行；不得再涉轻率，致干专擅之咎。将此由五百里谕令知之』。
又谕：『李鸿章电奏：「林椿云：巴德纳接外部电，华兵在越者尚未全退，仍踞几处地方；似指云军及刘永福。倘日久远约不退，恐澎湖未能早还」等语。四月十八、二十四日迭谕岑毓英将全军按期速撤，并严催刘永福一军撤回滇界；均电知张之洞转行遵照。据张之洞电称：越民游勇为梗，道路不通。该督究竟已否接奉前旨，云南官军及刘永福所部刻下已否撤竣？着该督即行遵旨迅速办理，一面将启程及抵界各日期由电奏闻；不得稍涉迟延，致令法人有所借口，贻误大局，自干咎戾。将此由六百里谕令知之』。
又谕：『电寄左宗棠等：闻刘璈请左宗棠由洋款内拨一百万办台湾善后，委员坐提。如果属实，所请断不准行。着左宗棠、杨昌浚懔遵前旨，查明所借洋款现存若干？迅奏候旨，不得轻率拨用』。
十二日（庚戌），谕〔军机大臣等〕：『岑毓英奏「覆陈边外情形并行抵文盘州布置要隘」一折，据奏拟将宣、兴以西归我及馆司设码头两相保护各节，该督于日前办法殊属误会。前于三月二十四日、四月初八、十八等日迭次电谕该督撤兵入关，并无一字令在关外布置。迨四月二十二日该督奏到撤师日期折内详陈关内外分扎各营，当经电谕令将关外各营一律撤回边界，勿逾定期。谕旨极为明晰，该督接奉后，自应懔遵办理。乃昨据李鸿章电称：「法使接外部电，华兵在越者尚未全退」；核计四月二十二日电谕已及两旬，何以尚未据该督电奏全数撤回？现在详约已定、基隆法兵已退，彼既如约办理，我若迁延撤兵之期，使彼有所借口，不特澎湖法兵未肯遽退，且恐别生枝节，贻误大局；该督岂能当此重咎耶！究竟关外各军及刘永福一军于何日一律撤退关内？即着迅速电奏。所有历次电谕七道，着再钞给阅看。将此由六百里谕令知之』。
又谕：『电寄岑毓英：据奏「行抵文盘州布置要隘」一折，所陈办法，殊属误会；本日已明晰寄谕该督矣。详约之定、基隆法兵已退，岑毓英务将关内外各营及刘永福一军一律撤回关内，不准托词迁延；究于何日撤竣？速即电闻』。
——以上见「大清德宗景皇帝实录」卷二百七。
十七日（乙卯），谕〔军机大臣等〕：『电寄左宗棠等：程文炳一军着即撤回湖北；应需饟项，着左宗棠、杨昌浚于洋款内发给，将来由鄂清算。所有余存洋款仍着存库，听候拨用』。
又谕：『电寄杨岳斌：所部暂缓遣撤；着将派查事件，赶紧查覆，再行听候谕旨』。
十八日（丙辰），谕军机大臣等：『电寄苏元春等：据李鸿章电奏「巴德纳照会称：谅山一带复到中国官兵三队，请饬撤回；澎湖本拟照约克期撤尽，迭闻此信，不无疑虑」等语。粤军早撤，必无复到谅山一带之事。惟张之洞前奏，越民有与法仇杀情事，难保非游勇勾结冒充华兵；着苏元春、李秉衡确查电覆。现在滇军及刘永福营已否一律撤回关内？日久未据岑毓英覆奏。此时滇、桂电信中途有无阻滞，着苏元春等速咨该督迅即遵旨办理，仍将滇军现在情形迅速电闻』。
二十二日（庚申），谕〔军机大臣等〕：『前迭谕岑毓英将关外滇军及刘永福营一律撤回边界，迄今日久，尚未据该督覆奏。法已退出基隆，并将虏去弁勇悉数交回；我军亟应如约迅撤，以昭大信。着岑毓英懔遵迭谕，赶速办理；毋再迟延，致干咎戾。将此由六百里谕令知之』。
又谕：『电寄张之洞：前迭谕岑毓英将滇军、刘永福营一律撤回边界，迄今未据覆奏。法已退出基隆，并将虏去弁勇悉数交回；我军亟应如约迅撤，以昭大信。着张之洞速咨岑毓英懔遵迭谕，赶速办理。现闻电线中断，应如何设法急递？并苏元春派赴谅山弹压之兵，何时撤回？均着迅速电闻』。
二十三日（辛酉），钦差大臣督办福建军务左宗棠等奏：『闽省官轮被毁，解运饟械并渡勇援台，类皆转雇商轮，诸多不便。现购买「富有」、「美富」两轮，以资遣用』。下部知之。
帮办福建军务前陕甘总督杨岳斌奏：『行抵基隆大营，与抚臣刘铭