击将军彭浚、兵备副使赵载御之退去。时张璁、桂萼必欲论九畴死，并罪廷和。）
上有旨，金献民闲住，九畴逮狱，下三法司议。兵部尚书王时中会同刑部尚书胡世宁等勘问九畴等事情。具疏曰：“虎仙父子深奸巨蠹，外通哈即卖国，内结钱宁乱政，心迹奸诡，死有余辜。及查王邦奇假建议为名，牵引浮泛，复图进用。该兵部题奉钦依降锦衣卫总旗，别难再议外，臣等议照政令莫大于刑赏，功罪在论其重轻，功之大者或可以赎罪，罪之轻者亦难于淹功。若乃功罪相伦，自亦情法有在，或无功而罪本轻，亦又有罪而事已结，俱不能一律而论。如陈九畴叨领边寄，举措乖张，先后启衅招尤，罪固已重；两次折冲御侮，功亦为优。又轻听回达之捏词，滥报番酋之真死，事虽出于传闻，情尤涉于妄诞。金献民仰承重命，提督西征，调集三边之军马，振扬全陕之威声，未足称劳，掠取他人之功次，妆成同事之捷音，何可冒荫？且连参随人员俱各滥升职俸，虽恩典出自于上，而辞受有负于初。再照彭泽彼时经略未成底定，因而致贻后患，罪有明案，缘曾抚回金印城池，既而回夷隔年入寇，功似可言。李昆、许宣、史镛、蒋存礼前后功罪与九畴相连，原情各有差等。张忠、杭雄始终往返，与金献民一时具奏，论法不宜异同。先任都指挥王辅开报传闻番酋之死，以致镇巡轻忽，会奏之虚，委属有违。卢问之初以预防生变为心，仍将应死夷囚擅决，亦非相应。以上各官俱合究治，但彭泽及陈九畴先经会问，题奉钦依为民。李昆已降副使，复起用，又降左参政，与彭泽俱致仕。许宣、史镛、蒋存礼亦经参提发落。合候命下之日，先将杭雄革去见任，与张忠俱候陈九畴、金献民问明之日，奏请定夺。彭泽罪犯与李昆、许宣、史镛、蒋存礼先已问结，似宜量处，臣等擅难定拟。及照董文忠虽故，与金献民、张忠、杭雄子侄等项冒授荫升，并一切参随人员，凡未至地方，混得滥升俸级，行委科道官会吏部主事从公逐一清查，奏请定夺。并先年斩获回夷中间未升功次人员，仍催促勘报，以凭升赏。臣等切念甘肃为中国右臂，土鲁蕃实禽兽与邻，变诈反复，乃虏寇之故情，功罪相寻，亦边臣所难免。仰惟皇上恩威信义，昭示无遗，蕞尔小丑，纳款有日。伏望普弘天地之度，丕昭日月之明，俯念各官曾效惟劳，早赐宸断。俾法司遵照议拟，上请施行。务严夷夏之大防，永存古今之治体，则德威所及，四夷无不畏服。”上诏：“各官功罪，你每既会议分别轻重等第奏来。陈九畴行事乖张，招尤启衅。以致回贼深入，残害地方。又妄报打死番酋，好生欺罔。难照常例，著兵部定发极边卫分充军。彭泽虽经黜革，后又朦胧起用，还革了职，照旧冠带闲住。杭雄与张忠俱待金献民提到问明之日，奏请定夺。各官子侄冒受荫升官职俱革了，其余参随人员功次，还着科道官会同兵部委官从公逐一清查，具奏定夺。李昆、许宣、史镛、蒋存礼、董文忠各降二级。”
已而起王琼为兵部尚书，代王宪。琼疏曰：“臣蒙恩起用，提督三边。自入关交代以来，查得黄河套内贼情即今稍缓，惟有土鲁蕃夷情未甯，急当议处。臣历考往事，正德八年以前，土鲁蕃虽尝虏杀忠顺王，朝廷亦尝拒之而不遽绝其贡，直尝在我，曲尝在彼。而彼又不知我边之虚实，未尝提兵一至沙州近边寇掠，况敢窥肃州之门户？彼时朝廷处之既得其宜，守臣又不敢任情恣肆。虽或时与哈密构衅，曲自在彼，旋复底定。自正德十年以来，执政者昧于经国之图，引用非人，相继坏事。既增币约，自失信义，又淫刑杀降，大失夷心。直反在彼，曲反在我。肃州之败，甘州之惨，由我致之，不可独咎土鲁蕃也。此时使甘州守臣即能如杨一清之义度量时势，曲为抚处，尽遣他国贡使出关，奏发羁留哈密、土鲁蕃贡使回归本土，而又谕以前守臣坏事之意，使等分任其咎，土鲁蕃必翻然悔罪，照旧通贡，不待至今日屡廑九重之虑矣。奈何守臣之计不能出此，漫谓土鲁蕃服而又叛，去而复来，非信义之所能结。往往大言以张虚名，不顾酝酿渐成实祸。既将已经奏准遣还夷人自今不放，又将新贡夷人羁留肃州，自谓使之进不得贡，退不得归，操纵在我以慑其骄悍之气，盖止知泥古欲绝其入贡之路，而不知度今不能绝其入寇之路也。前此土鲁蕃令牙木兰来沙州住坐，乞放出进贡夷人带回赏赐，彼即退还哈密城池并抢去人口，在我自当推赤心置其腹中，许之可也。而守臣乃以为未有悔过输诚实迹，令其将先年抢去人口头畜尽数送还，及将教唆犯边首恶绑送甘州，又令其访取忠顺王的派子孙承袭。凡此皆自示以疑而又责以难从之事，教之使不得和也。自嘉靖三年犯边后，至今三年矣，议者执持两端，含糊展转，迄无定谕。即今土鲁蕃因牙木兰住沙州二年，不得通贡，遂听谗言，疑其与中国通，欲并罕东等头目诛之。牙木兰等惧，今年四月急率其部落五千余众归附。甘州守臣不得已纳之，是又一大变矣。自土鲁蕃两入甘肃，肆行杀掠，未遭挫损，彼固已有虎视河西之意。而关外赤斤、苦峪、曲先、蒙古、罕东诸卫昔为肃州藩篱者，尽皆逃散避难入关矣。万一土鲁蕃怨牙木兰之薄己，卷土重来，我之边备废坏，又值天旱米贵，