黄镛复入台湾，割泉州、漳州以赂经，且请尽师船归之经；曰：『王将水、吾总陆焉，江、浙不足平也』！夏四月，经使柯平入福州报聘，精忠已据全闽，悔割地，且耻乞援；遂叛约曰：『将分地战耳』。经恶之，留陈永华守台湾，自帅侍卫冯锡范、左武卫刘进忠、右武卫刘国轩、参军陈绳武、吏科洪磊，称永历二十八年，发台湾。
五月，郑经取铜山及金门，至于思明州；父老姻故，咸与问劳。闽中故多郑氏部，又不直精忠；闻其至，海澄总兵赵得胜首以其部降；会兵攻同安，华尚兰亦降。得泉州将张学尧孥，厚抚而招之；学尧、施凤以水陆军先后降。精忠键福州，而使王进守泉州；进与降将赖玉、戴国用恣不义，王进功子锡范阴约经师，诱玉执之，遂攻进。相持竟日，经舟大至，进遁惠安。
六月，郑经入泉州；杀赖玉，亦绞杀国用，民大悦。黄梧已疽死，其子芳度守漳州；经招之曰：『果抒悃，当弃前愆』。芳度杀刘豹降；经封之为德化公，所乞无不应。芳度卒自畏，阴使通表于大清；经羁縻之。降将刘炎在漳浦，经使赵得胜、冯锡范、何佑击之罗山，刘炎及降将刘成福、余鸿弼皆败绩；得胜急攻之，三人皆降。值精忠党刘进忠被围于潮州，精忠不能救，乞降于经；使金汉臣援之，败绩。
秋七月，精忠再使来求和，且乞泉州；不许。
九月，精忠使王进攻泉州，步骑二万，杀掠及惠安；刘国轩严阵待。相持旬日，进却，屯枫亭，连营三十里。国轩轻骑觇之，猝遇诸涂，许耀战少却；国轩分其军自辰加巳，搏击不已。进大败遁，全军尽失；追之，三日夜不止。进大奔，国轩师次兴化城，乃止。
尚之信攻潮州，城坏逾百丈，进忠誓守。赵得胜援之，击其兵于黄冈，大破之；其众烧营走。
初，吴三桂自立于云南，遣使通台湾；经遣推官陈克岐、副将陈文焕报之。三桂再使钱黯来通好，闻其与精忠恶，使周文骥来言：『毋操戈，遗敌笑』。精忠亦使潘日兴来和，经曰：『耿王能如约者，听』。精忠再使张文韬如泉州贺，馈以五艘；经使郑斌往立约，以枫亭为界。旋复隙。
康熙十四年（台湾仍称永历）春，广东将苗之秀、张国勋皆赴经降，经取韶州；以惠州弱，使刘国轩并夺之。之信愬之吴三桂，三桂使以惠州与经，且与和；国轩入守之。
三月，经使薛进忠攻吕花于马跳，永春知州郑时英谕之降；经杀花，没其产，恶其拒命也。进忠攻沈瑞于饶平，不克；何佑至百子桥，遇尚之孝兵，击败之，瑞乃降，尽执诸降官畀经。经封瑞怀安侯。进忠密请封黄芳度，经曰：『芳度必死之寇也』！夏五月，经自泉州如海澄，觇漳州；旬日，芳度不入见。使郑斌说之，不听；阴使乞师于尚可喜。
刘国轩入潮州，遂与何佑、刘进忠徇广东郡州之未下者；至于东莞，守将赵天元降。国轩以师老将还，尚之信纠步骑十万人攻之；晨压何佑军，战于鲎母山。佑以身先，挥旗贯阵；国轩纵步骑驰之，斩首二万有奇、捕虏逾七千，奔踣遍山谷。之信大败，走广州；国轩、何佑之名震南粤。
六月，经攻漳州，黄芳度叛守，后镇万宏中炮死；经益围之。复以军趣兴化，马成龙降经，使许耀守之；寻以赵得胜代。冬，经兵围漳州逾二百日矣。其将吴淑开门降，芳度入井死；经执其孥，尽杀之；凿黄梧棺，戮其尸，以报海澄之役。进至邵武，杨德以城降。何佑自潮州攻和平，赖升亦降。经有泉、漳、兴、邵及广东之惠、潮州；又入浙江掠温、台至于舟山，其势特盛。
始，经在台湾，文吏惟立御史总制，以陈永华为之；协以五官，洪磊为吏官、杨荣户官、郑斌礼官、柯平刑官、杨贤工官暨六科都事、承宣、宾客诸司。既入福建，则以郑省英为宣慰使，督各郡租赋。易丁租曰毛银，人月敛银五分；舟船计丈尺税之，曰梁头。以吴慎为屯田使，清收屯税；以陈达章榷泉州盐、冯锡圭榷漳州盐、郑珍英榷潮州盐，石税四钱；以六官征富民缙绅赀，以饷司征杂税。以诸州令司抚字，以诸将分守各邑。其亲军曰侍卫，冯锡范掌之；曰勇卫，留守陈永华掌之；曰左、右武卫，刘国轩、薛进忠掌之；曰左、右虎卫，何佑、许耀掌之；曰五卫，施福统之；曰銮仪卫，艾征祥掌之；别立果毅、折冲、五卫、五行、五兵、左右先锋、前锋、后劲、中权、戎旗诸镇及角、亢、氐、房、心、尾、箕、斗、牛、女、虚、危、室、壁、奎、娄、胃、昴、毕、觜、参、井、鬼、柳、星、张、翼、轸凡二十八营，五提督节制之。凡台湾政事，陈永华为主；军中文武事，则参谋陈绳武及冯锡范主之。使转台湾之米食闽民，大收水陆部众益其军。英吉利、荷兰、万丹、暹逻、吕宋、安南各致其物互市于思明，烟火里市几复旧。
康熙十五年（台湾仍称永历）夏五月，郑经取汀州，刘应麟降。耿精忠所据，建宁、延平及福州一城而止；经且涎之。时杨捷以兵攻舟山，经将走去。韩大任至汀州，将与经合；姚启圣诱降之。
秋九月，