』!承畴等乃入朝见;命上殿坐,赐茶。上语承畴曰:『朕观尔明主,宗室被俘,置若罔闻。将帅力战见获、或力屈而降,必诛其妻子,否亦没为奴;此旧制乎、抑新制乎』?承畴对曰:『旧无此制。迩日诸朝臣各陈所见以闻于上,始若此尔』。上因叹谓:『君闇臣蔽,遂多枉杀。将帅以力战没敌,斥府库财赎而还之可也;奈何罪其孥!其虐无辜亦甚矣』!承畴垂涕,叩首曰:『上此谕,真至仁之言也』。上还宫,命宴承畴等于殿上。宴毕,使大学士希福等谕曰:『朕方有元妃之丧,未躬赐宴;尔等勿以为意』!承畴等复叩首谢。庄烈帝初闻承畴死,予祭十六坛,建祠都城外,与邱民仰并列。庄烈帝将亲临奠,俄闻承畴降,乃止。承畴既降,隶镶黄旗汉军,太宗遇之厚。然终太宗世,未尝命以官。
顺治元年四月,睿亲王多尔衮帅师代明,承畴从。既定京师,命承畴仍以太子太保、兵部尚书兼右副都御史,同内院官佐理机务。旋与同官冯铨启睿亲王,复明内阁故事:题奏皆下内阁拟旨,分下六科钞发各部院。九月,上至京师,与铨及谢升奏定郊庙乐章。
二年,豫亲王多铎师下江南;闰六月,命承畴以原官总督军务,招抚江南各省。铸招抚南方总督军务大学士印,赐敕便宜行事。是时,明唐王聿键称号福建,其大学士黄道周率师道广信、衢州,向徽州;左佥都御史金声家休宁,募乡兵十余万屯绩溪。诸宗姓,高安王常淇保徽州;蕲水王术■〈车岂〉子常■〈巛上水下〉自号樊山王,屯潜山、太湖间;由■〈木产〉号金华王,据饶州;谊石号乐安王、谊泐号瑞安王,分屯溧阳、金坛、兴化诸县。荆本彻以舟师驻太湖败,复入崇明:皆为明守。承畴至官,招抚江南宁国、徽州、江西南昌、南康、九江、瑞州、抚州、饶州、临江、吉安、广信、建昌、袁州诸府。十月,遣提督张天禄、总兵卜从善、李仲兴、刘泽泳等攻破绩溪。十二月,进破道周于婺源;声、道周见获,皆不屈,送江宁杀之。总兵李成栋破崇明,本彻走入海,杀其将李守库、徐君美。三年十一月,遣总兵马得功、卜从善等击破司空寨,斩守寨石应琏、应璧等五人,获常。既,宜石、谊泐合兵二万犯江宁;承畴先事诛内应西沟池、万德华、郭世彦、尤居等八十余人。谊石等攻神策门;分兵出朝阳、太平二门,截谊石等后;乃启神策门,出城兵奋击,破之;追及摄山,斩馘无算。承畴疏请还京,以江南未大定,不允;赐其妻白金百、貂皮二百。八月,征南大将军贝勒博洛克金华,获谊石。九月,谊泐复犯江宁;承畴出御,追获谊泐及所置经略韦尔韬、总兵杨三贯、夏含章。十二月,天禄搜婺源严坑山,获常淇及所置监军道江于东、职方司许文玠等。四年二月,从善及总兵黄鼎攻宿松,获谊泐弟瑞昌王谊贵及所置军师赵正;下饶州,获由■〈木产〉及其族人常洊、常沘、常涫,并请命斩之:江南众郡县以次定。明鲁王以海转徙浙、闽海中,号监国,明诸遗臣犹密与相闻。四年四月,明给事中陈子龙家华亭,阴受鲁王官,谋集太湖溃兵举事;承畴遣章京索卜图往捕,子龙投水死。是月,柘林游击陈可获谍者谢尧文,得鲁王敕封承畴国公、江宁巡抚土国宝为侯,又得鲁王将黄斌卿与承畴、国宝书。镇守江宁昂邦章京巴山、张大猷以闻,上奖巴山等严察乱萌,命与承畴会鞫谍者,别敕慰谕承畴。粤僧函可者,为故明尚书韩日缵子;日缵于承畴为师生,函可将还里,乞承畴畀以印牌护行。出城,守者讥察笥中,得文字触忌讳。巴山、张大猷以闻,承畴疏引咎,部议当夺职;上命贳之。承畴闻父丧,请解任守制。上许承畴请,急归;命治丧毕,入内院治事。
五年四月,还京师。六年,加少傅兼太子太傅。疏请定会推督、抚、提、镇行保举连坐法;得旨:『自后用督、抚、提、镇,内院九卿咸举所知;得人者赏、误举者连坐』。八年闰二月,命管都察院左都御史。寻甄别诸御史为六等,魏管等二十二人差用、陈昌言等二人内升、张煊等十一人外转、王世功等十七人外调、降黜有差。煊疏劾吏部尚书陈名夏,因及承畴尝与名夏及尚书陈之遴集火神庙,屏左右密议逃叛;承畴又尝私送其母归里。疏入,上方狩塞外;巽亲王满达海居守,集诸王大臣会鞫。承畴言火神庙集议,即议甄别诸御史定等差,非有他也;并以送母未请旨引罪。名夏亦列辨,因坐煊诬奏,论死。未几,上雪煊冤,黜名夏;因谕『承畴火神庙集议事虽可疑,难以悬拟;送母归原籍未奏闻,为亲甘罪,情尚可原!留任,责后效』。九年五月,承畴闻母丧,命入直如故,私居持服;赐其母祭葬。九月,达赖喇嘛来朝,上将幸代噶,待喇嘛至入觐。承畴及大学士陈之遴疏谏,上为罢行;并遣内大臣索尼传谕曰:『卿等以贤能赞密勿,有所见闻,当以时入告。朕生长深宫,无自洞悉民隐。凡有所奏,可行即行;纵不可行,朕亦不尔责也』。十年正月,调内翰林弘文院大学士。
明桂王由榔称号肇庆,频年转战,兵熸地蹙;至是,居安隆所,云南、贵州二省尚为明守。诸将李定国、孙可望等四出侵略,南攻湖南南境诸州县、东陷桂林、西据成都,兵连不得息。五月,上授承畴太保兼太子太师、内翰林国史院大学士、兵部尚书兼都察院