侍中丁潭侍从，不离左右。幽厄之中，超犹启帝，授《孝经》、《论语》。峻使左光禄大夫陆晔守留台，逼迫居民，尽聚之后苑，使匡术守苑城。尚书左丞孔坦奔陶侃，侃以为长史。初，苏峻遣尚书张闿权督东军，司徒导密令以太后诏渝三吴吏士，使起义兵救天子。会稽内史王舒以庾冰行奋武将军，使将兵一万，西渡浙江；于是吴兴太守虞潭、吴国内史蔡谟、前义兴内史顾众等皆起兵应之。潭母孙氏谓潭曰：“汝当舍生取义，勿以吾老为累!”尽遣其家僮从军，鬻其环珮，以为军资。谟以庾冰当还旧任，即去郡让冰。苏峻闻东方兵起，遣其将管商、张健、弘徽等拒之；虞潭等与战，互有胜负，未能得前。陶侃、温峤军于茄子浦；峤以南兵习水，苏峻兵便步，令：“将士有上岸者死!”会峻送米万斛馈祖约，遣司马桓抚等迎之。毛宝帅千人为峤前锋，告其众曰：“兵法，‘军令有所不从’，岂可视贼不击!”乃擅往袭抚，悉获其米，斩获万计。约由是饥乏。峤表宝为庐江太守。陶侃表王舒监浙东军事，虞潭监浙西军事，郗鉴督扬州八郡诸军事。令舒、潭皆受鉴节度。鉴帅众渡江，与侃等会于茄子浦，雍州刺吏魏该亦以兵会之。丙辰，侃等舟师直指石头，至于蔡洲。侃屯查浦，峤屯沙门浦。庾亮遣督护王彰击峻党张曜，反为所败。
六月，苏峻党韩晃陷宣城，杀内史桓彝。诸军初至石头，即欲决战，陶侃曰：“贼众方盛，难与争锋，当以岁月，智计破之。”既而屡战无功，监部将李根请筑白石垒，侃从之。夜筑垒，至晓而成。闻峻军严声，诸将咸惧其来攻，孔坦曰：“不然。若峻攻垒，必须东北风急，令我水军，不得往救。今天清静，贼必不来。所以严者，必遣军出江乘，略京口以东。”已而果然。侃使庾亮以二千人守白石，峻帅步骑万余四面攻之，不克。王舒、虞潭等数与峻兵战，不利，孔坦曰：“本不须召郗公，遂使东门无限，今宜遣还，虽晚，犹胜不也。”侃乃令鉴与后将军郭默据京口，立大业、曲阿、亭三垒，以分峻之兵势，使郭默守大业。壬辰，魏该卒。祖约遣祖涣、桓抚袭湓口；过皖，因攻谯国内史桓宣。毛宝往救之，为涣、抚所败。还击涣、抚破走之，宣乃得出，归于温峤。宝进攻祖约军于东关，拔合肥戍，会峤召之，复归石头。后赵将石堪、石聪攻寿春，祖约众溃，奔历阳。
苏峻腹心路永、匡术、贾宁闻祖约败，恐事不济，劝峻尽诛司徒导等诸大臣，更树腹心，峻雅敬导，不许。永等更贰于峻，导使参军袁耽潜诱永使归顺。
九月戊申，导携二子与永俱奔白石。陶侃、温峤等与苏峻久相持不决。毛宝说侃兴兵使上岸，断贼资粮，侃然之。加宝督护而遣之。侃分米五万石以饷峤军。毛宝烧峻句容、湖孰积聚，峻军乏食。张健、韩晃等急攻大业；陶侃将救大业。长史殷羡曰：“急攻石头，则大业自解。”侃从之。庚午，侃督水军向石头。庾亮、温峤、赵胤帅步骑万人从白石南上，欲挑战。峻将八千人逆战，遣其子硕及其将匡孝，分兵先薄赵胤军，败之。峻方劳其将士，乘醉，望见胤走，曰：“孝能破贼，我反不如!”因舍其众，与数骑北下突阵，不得入。将回趋白木陂；马踬，侃部将彭世、李干等投之以矛，峻坠马，斩首，脔割之，焚其骨，三军皆称万岁。余众大溃。峻司马任让等共立峻弟逸为主，闭城自守。温峤乃立行台，布告远近，凡故吏二千石以下，皆令赴台；于是至者云集。韩晃闻峻死，引兵取石头。管商攻亭垒，督护李闳，轻车长史滕含击破之。商走诣庾亮降，余众皆归张健。
四年正月，光禄大夫陆晔及弟尚书左仆射玩说匡术，以苑城附于西军；百官皆赴之，推晔督宫城军事。陶侃命毛宝守南城，邓岳守西城。右卫将军刘超、侍中钟雅与建康令管旆等谋奉帝出奔西军。事泄，苏逸使其将任让将兵入宫，收超雅，帝抱持悲泣曰：“还我侍中，右卫!”让夺而杀之。冠军将军赵胤遣部将甘苗击祖约于历阳。戊辰，约夜帅左右数百人奔后赵，其将牵腾率众出降。
苏逸等并力攻台城，焚太极东堂及秘阁。城中大饥，米斗万钱。
二月，大雨霖。丙戌，诸军攻石头，建威长史滕含击苏逸，大破之。
苏硕帅骁勇数百人渡淮而战，温峤击斩之。韩晃等惧，以其众就张健于曲阿，门隘不得出，更相蹈藉，死者万数。西军获苏逸，斩之。滕含部将曹据抱帝奔温峤船，群臣见帝，顿首号泣请罪。杀西阳王羕，并其二子播、充及彭城王雄。陶侃与任让有旧，为请其死。帝曰：“是杀吾侍中右卫者，不可赦。”乃杀之。司徒导入石头，令取故节，陶侃笑曰：“苏武节似不如是。”导有惭色。丁亥，大赦，张健疑弘，徽等贰于己，皆杀之。帅舟师自延陵将入吴兴。乙未，扬烈将军王允之与战，大破之，获男女万余口。健复与韩晃、马雄等西趋故彰，郗鉴遣参军李闳追之，及于平陵山，皆斩之。时宫闱灰烬，以建平园为官。温峤欲都豫章，三吴之豪请都会稽。司徒导曰：“孙仲谋、刘玄德俱言‘建康王者之宅’。古之帝王，不必以丰俭移都；苟务本节用，何忧凋弊!若农事不修，则