、南京锦衣等卫驾驶快船正军，既已月支米一石，及遇差遣，又支行粮四斗，实为冗费。今后正军出差，不与行粮。江淮、济川二卫水夫，并准此例；一、南京各卫屯田之设，本欲种纳子粒，供给军士。比因征操运粮差占数多，屯田废弛。今议每年自十月至明年三月赴操，月支粮五斗；四月至九月，仍旧屯种，不支月粮，比较子粒。其运粮者，既支行粮，月粮亦住支；一、南京光禄寺、太常寺厨役，共一千余名，每名月支米一石，虚费甚多。今议有家小者，月支米六斗；无家小者，月支米四斗。”悉从之。癸酉，南京光禄寺奏：“五月间大水，朝阳门外养牲房皆坏，乞令南京工部修理。”从之。己卯，谪直隶淮安府知府程宗戍辽东，坐擅集民船六十余艘，为太监金英家奴李庆等载货，且事后受其纻丝等赂也。戊子，大理寺右寺丞李茂言：“奉命阅视南京，其兵备实多废弛，且以所急言之，南京为祖宗根本重地，所宜高城深池，以备万一之虞。奈各门城楼，未设椠枝并锁钥，炮铳之备皆无，近城山坡可以通人往来，而巡铺有去城十里之外者，遇警何恃以为固。”又言：“军士贵练习，兵器贵坚致。南京官军舍余虽常操练，然止用纸布盔甲，临敌岂能披坚执锐。操江战船，多有朽敝，不堪遇战，岂能出奇取胜。乞敕该部移文守备文武之臣，原未设者设之，原有而敝者修之。接城山坡，挖掘陡峻，以断行人。巡铺远者徙置近地，以严守备。则城池有金汤之固，军士熟战攻之具，而外患不足忧矣。”从之。乙未，南京水军右等卫、淮安府盐城等县军民管运粮米至通州张家湾等处，被骤水冲没，船米俱失。户部请令来岁如数运通州补纳。从之。
九月壬寅朔，户部言：“近日虽放江南军回位运粮，欲苏民力。然粮多军少，先调征广东军所遣粮亦无人运。乞不为例，于河南、山东、苏、松府、县有巡抚官处，仍行各官提督，其余无巡抚官处，俱遣本部官督同所司，令民攒运。”从之。癸丑，敕谕兵部尚书、靖远伯王骥曰：“南京国家根本重地，安民御寇，必得端重老成刚果之人，始足以副委任。今将命尔往彼总督机务，与同守备太监袁诚等及丰城侯李贤等，同心协力，整饬兵备，严督训练兵马，固守城池，抚安人民。但遇远近贼寇窃发，即相机调兵抚捕；有废坏者，即酌量修理。与夫利当兴，弊当革。凡百事宜听尔会同守备、守官及各衙门计议区划，务在盗息民安，兴利革弊。毋或安于故常，致人嗟怨。尔受朝廷委重，必持廉秉公，勤慎率下。毋自忽怠，有妨公道。尔其钦承朕命，勉之，慎之。”辛酉，修南京正阳门城垣并中和石桥。命以南京龙江批验所掣余盐，准给南京各衙门官俸，每盐三斤折米一斗。从户部奏请也。己巳，免直隶扬州府宝应县淹没地亩租税，凡免米豆五千二百八十余石，草一万一千七十余束。
十月庚辰，敕刑部右侍郎耿九畴曰：“往者命尔巡视盐法，今时命尔不妨前事，仍兼巡抚凤阳、淮安、扬州、庐州四府、滁、徐、和三州，抚安兵民，赈济饥荒，修治水利，劝课农务，筑浚城池，操练官军，修补军械，但有贼盗生发，即调官军、民兵剿捕。官员中有廉能公谨者，重加奖劝，贪酷不才者，依律黜之，尤须禁治豪强刁泼之徒。凡有事听尔便宜区划，惟勤惟慎，乃克有济，尔其勉之。”
十一月丁未朔，户部盲：“直隶松江府运折粮官银十万余两，比因河冻，自清河县陆运赴京，恐中途有盗贼，请令锦衣卫遣官领军校驰往防护。”从之。乙卯，修直隶太仓卫吴淞江等处旱寨城垣。
十二月甲戌朔，都给事中林聪等奏：“昨户部署员外郎黄琛往究苏、松等处侵欺钱粮，言犯者无名数，难以执问，户部尚书金濂等奏，欲下巡按御史查勘；都察院左都御史陈鉴等奏，欲仍令琛戴罪往追征之。臣等以为都御史执法之司，户部钱谷之任，今互相推托如此，宜究问。”诏户部、都察院各差能干官一员同琛往查究之。应追征者即追征，分豁者即分豁，侵欺者，具闻处置。丁酉，工部奏：“近闻通州抵徐州运河一带，皆淤塞不通，不疏浚恐妨漕运。徐州等处，请敕佥都御史王竑；通州等处，宜遣在京大臣一员，提督疏浚。”诏不必遣大臣，其令都察院择御史廉能者一人往理之。
二年正月甲寅，诏南直隶巡按官各提督所司，掘灭蝗虫遗种。
二月甲申，少保兼兵部尚书于谦言：“昨者靖远伯王骥奏，南京雷雨击损大报恩寺等塔。”戊子，刑部尚书俞士悦等言：“南京灾异，诏命三法司行在外军民衙门，疏见监囚罪情可矜疑者，乞敕两京三法司俱审录具闻。”从之。给疏徐州至淮安河道人夫口粮。庚寅，敕谕南京文武百官：“迩者上天垂戒，雷雨震击大报恩寺塔。灾异之来，固朕不德所致，亦由尔等在彼不能修职或玩岁愒日，怠弃天工，或假公营私，妨废正道，以致军民嗟怨，责见于天。若非改过自新，何以转灾为福。敕至，尔文武百官，各务省乃躬修乃职，俾公道照明，人心欢悦，庶可少回天意。所有台行事件，条列于后，尔等其钦承之，毋忽。一、南京根本之地，军政最为紧要。尔兵部尚书、靖远伯王骥并守备