选主事，署郎中事。昌时好结纳，通司礼太监王化民等，欲转铨司；郑三俊尝以访乡人徐石麒，答曰：『君子也』！三俊遂荐于上。盖石麒畏昌时，故誉之；而三俊不知也。
清兵攻德州不克，往西北；别部攻武定州，拒却之。俄守备放炮，误伤臂；守者溃，城遂陷。
李自成杀其党罗汝才、贺一龙。自成招两人宴，汝才疑，不至；先缚一龙。凌晨，二十骑突入汝才营，斩之。汝才，延安人；同李自成、刘国龙投高氏营。高氏败，自成为雄。自成兵善攻，汝才兵善战；而汝才淫侈，自成忌汝才，并斩其主谋贡士尤玄珪，分其兵。自成遂伪称「倡义文武大元帅」，次权将军、次制将军；权将军刘宗敏狡悍善战，贼恃之。
癸卯，以礼部尚书东阁大学士吴甡兼兵部尚书，督师平寇；赐尚方剑，给五万金旌功。吴甡遂上言：『今日集兵措饷，必须巩固江南而可恢复江北；而武昌、九江，其要冲也。臣宜先往金陵，急趋九江、武昌，相机进止；且可调集兵饷接济江北，令各抚、镇兵扼险，共为应援』。上是之；遂议设标兵二万。
盗陷武冈州，杀岷王。时常德、武陵、衡、桂蛮獠皆伺隙，土寇勾引攻掠。
免直隶、山东残破州县去年田租。
命总督凤阳马士英移兵攻永城刘超。士英前调贵州兵五百，至乐平、婺源淫掠，婺源人飨于汪氏，一夕毁之；士英乃劾徽州知府唐良懿、推官吴翔凤。
兵部右侍郎倪元璐召对，申奏曰：『今之本谋，存乎主术，力行仁义，提振纪纲，爱惜人才，崇尚气节；定心志、一议论、信诏令、慎刑赏，其下则竭忠毕力惟是求。如此，何患大功不成、太平无日乎！臣沿途凡遇兵将，辄称实可畏；而遇难民，皆云实可图。盖兵将见形，难民见情。凡称铁骑精兵绵亘数十里冲突飘忽、所向无前者，形也；兵将见而震之。兵归营散涣疏略，而辽人与西人心志不一者，此其情也；难民入中而知之。夫攻形用力，攻情用谋。今行间诸臣，乌能知用谋者乎！乃今诸将报功，徒以夺回难民，张皇露布；此于九牛之一毛，何须急传！饬各路制奇设伏，直捣中坚，自可得志；而机宜在乎足财安民。以臣愚见，督、抚行军，必假利柄；一切屯、铸、盐、榷之务，悉听便宜：则可以布谋而制胜矣』。上善之。
翰林院检讨汪伟上言：『创大业者，必先扼险要而后可以言进取；定大乱者，必先固根本而后可以言荡除。臣世籍金陵，请以今日之急务陈之。金陵城周百二十里，竟一日之足不能遍，集十万之众不能周。是以策留都者，谓无守城之法，止有守江之法。贼自北而来，则淮为之防；贼自上而下，则九江为之防。故御淮，即所以御江；守九江，即所以守金陵。考之地形，武昌譬之大门也，九江譬之阶除、太平譬之堂奥也。宜设重臣驻节武昌，上为图荆、襄，修复显陵之本；下为扼蕲黄、接九江，巩壮孝陵之势。至于九江，宜建督抚；太平、采石，宜命南京侍郎建牙于此。若文武操臣，宜驻师新江口，以专堤防、备策应。江北浦口，江南颇狭，一苇可航；宜以侍郎一人守之，仍命巡江御史防江，防之所不及，辑陆路之暗通者：此金陵之布置也。至防江，以兵为急。臣按南京营兵，旧称十万有余；实核之不过三万耳，乃兵亏而饷不减。宜依旧额补足，使江上督、抚分而领之，自可得防守之助矣。江守，以舡为急。臣察新江口舡，旧额四百有奇；今存者百十只耳。舡只钱粮亦有旧制，一一清出，补足原数；而新设之汛地，尤宜多造舡只，自可备中流之击矣。或饷有不足，暂借盐课并截漕艘，此亦设处之一法也。防守既备，务守扁舟不得渡江，孝陵即可安堵。孝陵既安，然后显陵可规进取。金陵所系如此，其图之可不早而言之可不详耶』！
夏四月乙丑，御史祁彪佳劾吏部文选司郎中吴昌时紊制弄权，山东道御史徐殿臣、贺登选合疏劾之。
改会试期至八月。
戊辰，大学士周延儒自请督师，襄城伯李国桢请选官舍锐士从征；报可，赐宴于武英殿。丙戌，延儒奏捷，斩百余级。时边墙毁折，所掠子女、金帛，稛载出入如织；卒无一矢加遗也。
释轻囚
命御马监太监李国辅谕援剿总兵左良玉。良玉奏辨：『副总兵王允成实未尝叛；营兵不戒，臣已治之』。继而上闻良玉已诛允臣，特赐金、币；而允成固在，言杀者乃讹传也。
清兵至琉璃河，命各督、抚……。辛巳，战于螺山，八镇皆走，惟步营两监军御史在；御史蒋拱宸饰功报捷。
壬午，复朱国弼抚宁侯。
张献忠陷麻城，署县教谕肃颂圣杀。
是月，鄢陵陨霜杀麦，饥民食蓬实。
五月甲午，召周延儒入朝。
丙申，令延绥、宁夏、甘肃各兵即遣监军速驰河南听豫抚调发。时巡抚河南右佥都御史秦所式上言：『中州大势，闯□蹂躏五郡八十余城，尽为瓦砾；及革、左诸寇由宛、汝跨江、汉，旬日陷数名郡：此流寇之大略也。自永城以至阌乡、灵宝，自宛、汝抵河岸方千里之内，皆土贼栖山结寨，日事焚掠：此土贼之大略也。办贼必须兵，旧抚余兵不及二（千）人，陈永福残卒未及四千；合卜从善三千余