淑女。辛巳，赐北京死节诸臣工部尚书兼东阁大学士范景文等二十二人赠谥、祭葬有差；建祠鸡鸣山，赐额「旌忠」。癸未，对□□□□□□郑芝龙为南安伯。以前福建布政使司左布政使申绍芳为户部右侍郎兼都察院右佥都御史，督饷江北。以前太子太保礼部尚书兼文渊阁大学士王应熊改兵部尚书，总督川、湖、云、贵等处，专办蜀寇；赐尚方剑一口、便宜行事，仍给银三万两。乙酉，以皇太后至京，加可法少傅兼太子太傅，弘图、曰广各太子太保，士英少保兼太子太师，铎太子少保，诚意伯刘孔昭等、太监韩赞周等各荫升有差。阮大铖入对称旨，疏陈江防甚悉，安远侯柳祚昌复荐之；以为兵部右侍郎，巡阅江务。都察院左都御史刘宗周劾奏，不听。
自李自成败走，山东诸州县并杀其伪防御使，牧令复为明；而朝廷无一官一兵出河北，清遂安置官属，至济、兖以南皆降于清，惟济定州不下。是月，清将杨方兴以兵数千趋济宁，下之。
九月戊子，封皇太后弟千户邹存义为大兴伯。庚寅，以都督佥事张福成充总兵官，前往河北、山东。辛卯，上御经筵。壬辰，裁各布政使司右布政使。甲午，曰广致仕。乙未，宗周致仕。命黄斌卿移屯九江、黄蜚屯芜湖采石、郑鸿逵屯镇江。丁酉，以中军都督府都督同知王之纲充总兵官挂荡寇将军印，镇守河南。
己亥，三法司奏定从逆六等条例。大逆凌迟处死凡五条：凡从贼攻陷京师及为贼毁宗社、易门榜者，凡倡率劝进及为贼草伪诏者，凡部院詹事翰林三品以上大臣从贼受官为之亲信用事者，凡文武封疆大吏如督抚总兵降贼者，凡京堂翰林科道部等官为贼画策规取地方者。以上如本犯不归、归而又逃者，收系其妻子，籍没其资产。斩决不待时凡三条：凡四五品京堂及翰林科道官受贼伪命居要地比原职加崇者，凡方面分巡分守知府等官降贼者，凡文武封疆大吏闻变先逃者。绞凡六条：凡献银献女献婢以媚贼求免者，凡内外衙门官但受伪命者，凡职在巡方遇变而逃者及布按三司分巡分守知府等官遇变逃者，凡被贼夹打不能自回仍受伪官者，凡受伪官为贼疏远者，凡各衙门奉差如管屯管河榷关司饷答官虽无封疆之责而逃者。流凡二条：凡内阁重臣及部院寺三品以上、詹事翰林五品以上、即不从贼、偷生潜逃者，凡既受伪职、后自疏远、先贼未败、脱身南还者。以上斩、绞、流及远戌共十一则，如各犯认非自投，议减本罪一等；如遁归匿形、蓄谋叵测，议于本罪加一等，仍收系其亲属。徒凡二条：凡候考候选即无官守、即未受伪官、乃浮沉贼中、贼奔乃还者，凡遇贼变偶不逃、为贼胁留、未受伪官者。杖凡一条：凡初为贼所拘、未受伪官、乘间先归者。上曰：『北都沦丧，帝后升遐，巷战死绥者，遂无一人？且反面事仇，甘心降贼，为之指斥先帝、规并海宇，人心已丧，法纪何存！所奏既已会议允当，并先夺职。其绞罪以上，三法司行抚按官逮至京讯之；流罪以下，抚接官依律即讯具奏。其有身虽陷贼而能改图归正、擒杀贼首及以兵马城池来归，或为我内应、克建大功，或为我内间、效忠本朝者，仍从优升赏，不用此例』。
辛丑，以通政司右参议王潆为都察院右佥都御史，巡抚登莱、东江等处，备兵援辽，恢复金、愎、海、盖，赞理军务兼管粮饷。以□□□□牟文绶充总兵官，镇守荆州，总理汉土官兵。时荆州未复，命文绶自施州卫收集士兵，出夔州以图之。癸卯，以后军都督府都督王允成充署总兵官，镇守岳州。士英请定童生纳银径送学道收考，免府县二试，其银以充兵部招练军器之用；从之。乙巳，给越其杰银十五万两，令募兵屯田。追赐国初诸臣陶安等、先朝谏死诸臣蒋钦等谥。丙午，召万元吉还。以右军都督府左都督杜弘域提督池、太等处军务。丁未，上皇考陵名曰熙陵。己酉，进封朱国弼为保国公，爵一等。辛亥，加李沾都察院左都御史。命法司逮问吕大器。以中军都督府右都督卢鼎充总兵官，武汉团练正纪宁南营务。开纳助工事例。癸丑，命刑部逮问黄澍。
是月，高杰率兵赴镇。户科给事中陆朗例出为福建□□□□□，特旨留之。御史黄耳鼎例出为江西按察司副使；与朗并疏攻吏部尚书徐石麒。
冬十月乙卯朔，石麒致仕，耳鼎复为御史。以中军都督府左都督李成栋充总兵官挂镇徐将军印，镇守徐州；□□□□□李世春充总兵官，镇守泗州；□□□□□贺允昌为中军都督府都督佥事充总兵官，镇守扬州。并巡上下江御史为一差。故周延儒子奕封乞免追赃；时有举入汪庶者与延儒弟举人正仪姻连，中旨欲移坐之而不许其名，以为曙也，遂坐曙赃六万，而免奕封所坐六万之半。丙辰，以郑芝龙充总兵官，镇守福建。以黔省援楚副将罗联芳为前军都督府都督佥事充总兵官，镇守贵州。己未，以逃官前兵部尚书张缙彦戴罪总督北直隶、山西、河南北军务，便宜行事。庚申，大学士高弘图致仕。遣司礼监太监孙元德察催直隶、浙江、福建金花岁改段价、九库一应钱粮，仍督两浙漕粮、盐课、洋税并一切修练储备事宜。甲子，加何腾蛟兵部右侍郎兼都察院右佥都御史，仍巡抚湖广全属地方。赐北京死