秋出战。成功遣将甘辉败之，彪、光秋弃城走；遂取之（三藩纪事本末、清史纪事本末）。
六月，提督刘忠率兵入连江县平贼（连江志）。
明桂王命少师兼太子太师吏兵二部尚书建极殿大学士姜曰广督师江西，恢复京湖闽浙（残明宰辅年表）。
鲁王兵部尚书大学士钱肃荣卒。王震悼，辍朝；赐祭，予谥荫（南疆绎史）。
七月，清帅佟国鼎、李率泰、陈锦合师逼同安，成功部将邱缙、林壮猷守大盈岭以扼泉师，金作裕守苎溪岭以扼漳师，知县叶翼云督民兵守城。清领旗黄有信率骁骑冲突，缙中流矢，壮猷不支遁入城，作裕闻之亦敛军回，分门死守。清师晓夜攻击。八月，城破，缙、壮猷、作裕皆巷战死。翼云曰：『今日犹得死于明土，吾辈之幸也』！与教谕陈鼎皆不屈死。清师以城内坚拒不下，屠之，死五万余人。初，同安有陈世冑者，绰号泥鳅；闻仙游罗汉山王志章能剌阴阳事，世称生阎罗，往候之。志章预置片纸，使童子授世冑读之，有「泥鳅死半途，同安血流沟，嘉禾断人种，安平成平浦」之语，悚然奔告成功；成功妄之。既而，世冑果至小盈岭暴亡。同安之屠，血流沟渠。是后，凡获满兵，辄断其踵放回，欲以厌「嘉禾断人种」之谶。嘉禾，厦门旧号也。康熙癸卯，李率泰请弃诸岛，安海城竟毁拆，厦门迁空无人者一纪，果断人种。安平在界外，亦遂成平浦焉（海上见闻录、小腆纪年）。
朱成功在铜山修船练兵，闻同安告急，整师往救。抵金门，而同安已破。清漳浦守将王起俸谋降事泄，弃家从旧镇奔铜山。成功以为总练，使同柯宸枢联络铜山等处募兵措饷，诏安县人林日灼鼓众拒之；成功令甘辉击斩日灼，复诏安（小腆纪年、清史纪事本末）。
浙闽总督陈锦奏郑彩等连■〈舟宗〉千余，盘踞长乐、连江等县；陈泰、李率泰分兵夹击，尽驱出海，长、连二县次第恢复。又统师直入兴化，生擒伪总督顾世臣等十二人斩之。兴化平（东华录、清世祖实录）。
有粤寇张、黄二姓，不知其名，由永定、上杭出清流属乡而抵延祥。杨禾兄弟恃勇与战，败死；寇遂出归化。时又有游僧伪称隆武者，愚民信之，亦聚众数百人。张、黄应之，同犯归化。归化坚壁以老之，乃去。至永安，游僧被诱，歼焉。张、黄独疑，不入城，宵遁。是时，四乡皆贼营矣（临汀汇考）。
清以张学圣巡抚福建（清世祖实录）。
十月，明封郑成功为威远侯。成功寻复云霄，降将张国柱败殁，守备姚国泰就擒（小腆纪年、清史纪事本末）。
鲁大学士马思理卒。沈宸荃相，刘沂春副之（南疆绎史）。
十二月，郑鸿逵、郑成功复福建沿海州县，奉表报闻于桂王（永历实录）。
是岁大饥，成功及彩各发兵民船至高州籴米；州为桂王总兵陈邦傅所辖，成功船免饷。时斗米千钱，海上藩镇分驻各岛，鲁王别将周鹤芝、周瑞、张名振、阮美守舟山，彩、联守厦门；鸿逵守安平之白沙，使其将陈豹守南澳；成功泊厦门，以芝鹏护家眷、张进守铜山、郑香守海澄之石尾（后为清兵所破，二子广海死焉）。粮饷缺乏，取之民间，而彩营将章云飞扰民尤甚。鸿逵遂率舟师至潮州，随地取饷。时闽中旧相张肯堂以私财募兵海上，鲁王贻书约共事（海上见闻录、三藩纪事本末）。
是年，清命霍达巡按福建（贰臣传）。
六年（海上称永历三年、一六四九）正月，监国鲁王次沙埕（南疆逸史、永历实录、三藩纪事本末）。
广东李成栋迎永历。诏各勋镇考试诸生赴广省，郑成功送生员叶后诏、洪初辟等十数人，同黄志高赍本赴行在。舟至潮阳，遭风不得达；独志高至粤，诏以为兵部职方司主事，使监成功军。封成功为广平王，命以舟师取南都；其后成功入长江，承此诏旨也。漳浦副将王起凤（一作俸）密赴成功纳款，谋泄，弃家由龟镇至铜山投见，授以都督同知，挂统练军门印（三藩纪事本末、海上见闻录）。
明郑鸿逵复泉州；入奏桂王，优诏奖励之（永历实录）。
浙闽总督陈锦奏福州总兵张应梦复罗源县，右路总兵马得功复永春、德化二县，擒其总师颜昌儒等，平三百余寨（东华录）。
开福建鼓铸（同上）。
二月，郭天材溃兵以铁骑千余突来攻宁化城，至夜遁去（临汀汇考）。
三月，清兵复取明宁德（小腆纪年）。
郑成功遣施琅、杨才、黄廷、柯（一作何）宸枢等攻漳浦，守将王起凤降；留黄廷、洪政守漳埔之罗山岭，柯宸枢守盘陀岭，自统兵下诏安，屯分水关（小腆纪年、三藩纪事本末）。
浙闽总督陈锦奏福清等二十县士民同心效死守城，忠义可嘉；请免本年丁徭，以示鼓励。奏下部议（东华录）。
夏四月，清兵克福安。明兵部尚书大学士刘中藻衣冠坐堂上，为文自祭，服金屑死。其部将董世南（小腆纪