当日之约，将联和二属，以成大事。今城中漳人任出入，而泉人移徙，辄遭劫。且约中禁滥杀。陆提之兵皆泉人，而无一免。吾恐他日兄弟之约不坚，复成分类械斗之祸』！丕建以语潮春，令止杀，限三日中，许民自去。虎鞭率所部巡北门，以捍泉人之出。改命林大用为镇北大将军，殉鹿港。大用亦泉人，鹿港之人鼓吹迎之，未久而去。黄季忠即筹守御，陈弄攻之不下。五月，总兵曾玉明以兵六百至鹿港。玉明亦泉人，曾任北路营副将，与戴、林有旧，寓书招之，不从。及潮春南下，以二十四庄附官军。命戴彩龙、郑玉麟、李炎等攻之。至燕雾下堡大庄赖登云之家索饷。茄苳脚庄拔贡陈捷魁密约庄人要之。六月十九日，二十四庄俱起，彩龙、李炎大败，被禽，解至鹿港受戮。玉麟力战死。于是漳、泉相睨，叶虎鞭降于军官。
七月十九日，林日成以林大用、陈九母、赵憨率众攻湳仔庄，破之，放火以毁。西至和美线，北及竹仔脚番社，追加寮潭，庄人陈耀御之，连战三日，不支，献马请降。日成不肯。陈九母、赵憨皆其佃，为求成，乃撒围。耀即乞陈清泉率勇二百驻李厝庄，又求援于新港柯、姚二姓，众至，遂举白旗以拒，日成怒，命林大用攻之，不克。八月十五日，日成率诸将誓师于大圣王庙。翌日，进攻白沙坑。陈捷魁又率众御，鏖战数日，互杀伤。日成登观音之山以望，见其庄固不可拔，呜金而退。复攻秀水，叶虎鞭中炮陷阵，黄丕建逸之。总兵曾玉明驻安东庄，固垒自完，故日成得无忌。闺月二十八日，争葫芦墩，与罗冠英大战于圳寮，廖世元阵没，张世英以其弟廖江峰领其众。冠英退屯翁仔社。
林向荣之入斗六门也，地绝险，粮运不通。潮春长围之，援绝；以龙眼核为粮，杀马食士。屯番不与，谋内应。九月十三日，放火焚街中，退入土城，士皆罢弊莫能兴，向荣自杀。国忠率所部十八人突围出，皆被禽，不屈死。管理粮台同知宁长敬、镇标游击颜常春、署斗六都司刘国标、守备石必得及弁兵数百人皆死。俘王飞虎，庄天赐以为壮士，免之。义首陈有才亦被执，潮春闻其勇，欲降之，不从亦死。于是议取嘉义，军师刘阿屘曰：『斗六既破，镇兵俱没。若悉我精锐，鼓行而南，则郡城必望风瓦解。既得郡城，据中枢以号令全台，则嘉义可不战而得。今若以全力争一小邑，胜负未可知；而嘉义城坚众协，恐急切未易下也』。潮春不听，令陈弄、严辨、吕梓、廖谈、洪花等攻之。黄猪羔亦来归，已而何守、陈ＦＦ各以众援，筑长围以困，数十步立一炮台，与城楼等，以瞰虚实。自是无日不战。辨妻侯氏、谈妾蔡氏皆勇敢，每临阵，骑马督率。城中亦竭力守御，故不破。陈弄、严辨遂攻涂库，陈澄清拒之，不能克。十月，别攻盐水港，亦不克。十一月初十日，林日成自攻大甲，十八庄起应，与官军战于大安庄。守备郑荣大败，进而围之。十四日，罗冠英援至。十七日，林占梅亦遣千总曾捷步率兵至。翌日，战于水堀头。官军先溃。冠英独奋斗，陷围不得出；柯九兴救之，乃免。日成环之，放火焚南门，城崩数丈，水道复绝，居民将渴死。何守为书射入城中曰：『我攻其兵，不害其民』。约以明日出汲，遂撤西门之围。然水辄罄，会大雨，日成乃去。二年春正月十八日，复围之。候补同知王桢率义首林盛拒战于磁窑庄。日成衣黄衣，张黄盖，麾众而至，官军复败。遂登铁砧山，祷于延平郡王，不吉而还。二月初五日，罗冠英、廖廷凤合攻新广庄，克之；又克坝仔，追四张犁。潮春久围嘉义，以陈梓生守之，据垒力战，各死伤，二十七日，庄破，林日成在四块厝庄闻之，遂集死士以拒。
初，署水师提督吴鸿源兵至府治，议出师，进驻盐水港，以降将吴志高为乡道。二月十二日，破马稠后庄，斩首百余级。次下茄苳，以吴邦基、洪金升分驻白沙墩，多设疑兵；以杨兴邦、张启煃驻水窟头，为犄角。而自将游击周逢时、守备苏吉良赴嘉义。嘉义被围已六月，城中无粮，捣龙眼核为粉，熬而食之，绅民死守。至是守将汤得升开门夹击，陈弄、严辨皆败去。鸿源命苏吉良、徐荣生攻刘厝庄等，疏通道路，以规复彰化。四月，伐南靖厝。吕梓之妻与罗彭胡拒战，竹围坚密，不能拔。吉良力攻，彭胡被杀，梓妻亦中炮死。五月，攻严辨于新港，进围大仑，吕梓降。六月十八日，义首陈捷三进驻沙仔仑，陈贞元助之；与杨目丁大战于浊水溪，遂复南投。义首陈云龙来援，进复集集。潮春檄所部复攻，义民力守。九月，陈大用以中寮降曾玉明。罗冠英、廖廷凤亦破大墩，以通阿罩雾，参将林文明迎之。然官军犹未敢进攻彰化，各地用兵，忽起忽仆。
诏以福建陆路提督林文察视师台湾。文察，阿罩雾人也，以十月至麦寮，登岸，径归其家。巡抚徐宗干亦奏简兵备道丁曰建会办军务，以兵三千，自北而南，驻牛骂头。十六日，林占梅率翁林萃、陈尚惠等，督勇首蔡宇以军三千进扎山脚，三路并攻。何守乞降。赵憨、陈ＦＦ犹据城。勇首林忠艺、林尚等奋勇而前，薄城下。十二月初三日，总兵曾玉明率林大用破北门而入，丁曰建、林占梅以次至。赵憨、陈ＦＦ、陈在、卢江逃四块厝庄，江有