，必有子弟人等随往；该兵丁内有在台湾病故损失者，自尚悬额未补，应即于该兵丁随行子弟内拣选补额，一体充任食粮、随营效用，亦可增添兵力。着交福康安、常青即行遵照办理』。
三十日（甲午），谕军机大臣等：『前据柴大纪奏到：「搜获贼匪伪札，内有「防守海口要隘」等语。必系虑及将来穷蹙之时，希图窜逸入海。可见贼人气馁，已豫思逃窜；将来官兵四路追剿，贼匪自必由海口遁逸，不可不加意严防。着福康安、常青等务须严饬弁兵于沿海各口岸要隘处所梭织往来，巡逻稽察；毋使贼人抢占船只，得以逃往洋面，致搜捕有稽时日』。
是月，钦差协办大学士陕甘总督办理将军事务福康安奏：『臣行抵厦门，询问贼匪情形近更猖獗，自凤山至彰化要隘处所半被贼据，南、北两路声气相通；每于官军经过之地从中突出邀截，以致郡城、诸罗两处受困日久。臣一到鹿仔港，即整兵前进，务将贼匪屯聚相联之处痛加剿杀，使其首尾不能相顾』。批：『是。以彼巧计攻彼，此语得之』。又称：『臣酌量情形，或带兵直抵诸罗、或进逼大里杙贼巢。要领既得，虽贼匪众多，无难克期歼灭』。批：『仍以安民为先，解其胁从。既安之后，仍当防之』。
--以上见「大清高宗纯皇帝实录」卷一千二百八十九。
冬十月初四日（戊戌），谕：『现在台湾剿捕逆匪尚未竣事，所有军需等项动用较多；着该部于邻近福建各省分酌拨银三百万两，令各该督、抚派委妥员迅速解往闽省备用』。
又谕曰：『成都将军鄂辉现在带领四川屯练兵丁，赴台湾剿捕贼匪。鄂辉久历行阵，于军旅较为谙习；亦着授为参赞，协同福康安筹办进剿，以期迅奏肤功』。
谕军机大臣曰：『福康安由厦门配渡前赴鹿仔港，仍声言由鹿耳门前进，使贼匪猝不及防；所办甚好。其所称常青等调度失宜、官兵多有损失及南北两路贼匪处处相通，而我兵相距辽远、声势不能联络各情节，实为切中肯綮。福康安于抵鹿仔港后，振作士气、镇定人心，探视贼踪所至，沿途搜捕；实为此时要着。至贼人狡猾伎俩，往往于官兵过后阻截道路；今福康安拟将贼匪屯聚相联之处并力截断，使其首尾不能相顾，是即因贼人之巧计用以攻贼，俾官兵所过之地不致旋通旋塞，深合机宜。惟福康安折内所称「沿途搜剿」一节，贼匪到处屯聚，所过村庄民人多被迫胁，今福康安统兵进剿，其经过地方固应乘势扫除，不使于官兵过后潜出滋扰；但所过村庄若悉行歼戮，恐一处被官兵剿洗而他处闻风畏惧，转坚其助贼之心。若不留心防范，而于所过村庄听其聚处，又恐奸猾之徒于官兵过后生心梗阻，致为肘腋之患。福康安务须随时体访，加意密防，使良善得安其心而奸宄无由逞其伎俩；此为最要。所过之处，其原派驻守官兵不可轻易撤调，以免疏虞』。
钦差协办大学士陕甘总督办理将军事务福康安、护军统领参赞海兰察奏：『臣等拟赴鹿仔港，于十九日登舟后，风信靡常，现在大担门守候。若得旁面顺风，亦可折戗行走』。谕军机大臣等：『海面九月内风色不正，此原不可过于焦急，轻易冒险。但十月向系平顺易渡，此刻虽因守风，稍为稽待；然似此兵威壮盛，机宜凑合，未始非成功先兆。李侍尧派令郑国卿带往本省兵三千名亦在大担门候风，自即与福康安一同渡洋。此内一千五百名，前据李侍尧奏拟拨往常青处；此时福康安到鹿仔港后，即日相机进剿，其郑国卿所带兵三千名竟可全数俱赴鹿仔港，不必拨往南路，更为壮盛』。
初八日（壬寅），两广总督孙士毅奏：『据护南澳镇副将郑元好禀称：千总庄大进运至台湾兵丁鞋裤、账房等项，行至铜山营洋面被贼行劫，现在躧缉查拏』。谕军机大臣等：『鞋裤、账房等项俱系运送台湾军装对象，被劫至一百余篓之多；看来竟系林爽文伙匪在洋面潜出邀劫，不可不严拏究办。此案被劫系在闽省洋面，李侍尧自应饬属一体严拏。但该督驻札厦门办理军务，照料官兵配渡，事务繁多，无暇兼顾；徐嗣曾现在省城，并无经理要件，竟着责成该抚督率所属实力查拏，务期按名弋获，毋使漏网。徐嗣曾于台湾剿匪事务，初时尚知留心，随时陈奏；后见贼匪肆扰日久，一时未能办结，未免心存畏难，转似置身局外，缄默不言，若与己无干者。徐嗣曾系本省巡抚，何得漠不相关若此！着传旨严行申饬』。
十四日（戊申），福州将军恒瑞奏：『近日贼匪滋扰盐水港，惟有悉力固守』。谕军机大臣等：『该处贼势尚在猖獗，恒瑞兵力有限，未免进退掣肘；幸所带之兵又续到五百名可资接应，恒瑞此时亦不必过于焦急，惟当在盐水港悉力固守，以待福康安到。若贼匪众多，势难守御，不妨竟弃盐水港回至常青处再图进取，亦是一策。但用兵之道，以攻击为先着、堵御为后着。今官兵所到转被贼人攻扰，我兵日以抵御为事；是官兵祗办接应、着着落后，而贼人转得占先，客主之势岂不倒置！恒瑞此时既不能前抵诸罗、又不能回至府城，亦断无在彼株守之理。况恒瑞在彼，贼匪不时滋扰，仍须堵御剿杀，不得休息