军自嘉义解围后，扫荡附近逆庄，迭有斩捦；斗六贼多败遁，官兵追至彰辖西螺、二重溪等处。曾玉明已由鹿港逼近彰城，首逆戴万生已窜回四张犁本庄，余逆仍扼踞死守。曾元福已出洋，即着督饬该镇星速前进，与曾玉明、吴鸿源等军合力进击。通判张世英调集番丁、督率义勇，直攻四张犁，将戴逆巢穴焚毁，是该处丁壮尚为可用；着徐宗干、洪毓琛檄令张世英等激励团丁乘胜搜捕，务将戴逆捦获，毋任漏网。南路既无匪徒蠢动，可无牵掣之虑。现在大军云集，兵力已厚；着即督饬各军奋力合击，将彰化、斗六次第克复，毋稍延缓。汀州府属，江、广游勇匪党扰及归化、顺昌等县地方，虽经乡团击败，仍恐各处游匪乘机窃发，更难保非在逃之李阿四勾结滋扰；自应乘其初起，及早扑灭。即着檄饬参将吴运升挑带壮勇，会同该地方官弁、民团合力防捕，迅图歼除；并将在逃之李阿四访拏务获，以净根株。将此由四百里谕知徐宗干,并传谕洪毓琛知之』。
－－见「大清穆宗毅皇帝实录」卷六十五。
五月初六日（辛亥），谕〔议政王军机大臣等〕：『耆龄奏「交卸督篆日期，并将所办防剿事宜及所部兵勇移交左宗棠接办」一折，湘师现以全力进致富阳，闽省援军自以严防贼由江西抄越后路为急。耆龄业饬飞虎等营移扎广丰，并令留扎兰溪之南康各营相机策应，即着左宗棠督饬在防将士实力扼守；其分防义桥、闻家堰及驻守处郡各军，并着左宗棠随时调遣，毋失事机。顺、永匪势蔓延，兵勇屡挫；亟应迅速扑灭，免致燎原。着徐宗干督饬赵均等各营合力进剿，迅将各股匪徒悉数歼除，毋留后患。台湾各军自嘉义解围后，连破贼营五十余座，并有击毙逆首林晟之事，是该处军威已振；徐宗干务当督饬吴鸿源等军乘胜进剿，扫穴捦渠。副将曾元福一军已由泉州酌渡，行抵鹿港；即令会同总兵曾玉明迅速进图彰化县城，庶分路环攻，可望克期蒇事。耆龄交卸事竣，即着驰抵福州将军新任，以重职守。将此由五百里各谕令知之』。
－－见「大清穆宗毅皇帝实录」卷六十六。
十八日（癸亥），谕〔议政王军机大臣等〕：『左宗棠奏「官军截剿富阳、新城援贼，大胜小挫；并遵筹裁汰闽军，及台湾等处军情」各折片，此次贼匪径犯新城，思袭富阳后路，虽经官军击退，而刘典、王文瑞两军尚须驻皖，蒋益澧全军力攻富阳，其余各营分拨上下各游防剿，兵力实不为厚；是克复杭州，尚难克期而待。左宗棠现拟将新隶闽军力图整饬，相机进剿，亦是因时制宜之法。即着将闽省营兵分别去留，认真训练，俾成劲旅。仍一面于闽、粤营官中慎选统领之员，派令分营管带；庶将识士心、士识将意，可收饷节兵精之效。至浦城地势，既无须重兵屯驻，即由左宗棠酌派一军驻之，以护转输运道。台湾小丑，剿办几及一年，总无起色；吴鸿源、曾玉明既均不能得力，即着与徐宗干妥慎筹办，申明军令，激励兵心，以期早日蒇事。沙县等处土匪狓猖，在事员弁办理情形，极为怠玩；若不从严参办，必致军心益懈、贼势益张，于闽省地方大有关系。即着左宗棠迅速查明，严参惩处，毋稍徇纵。至闽省吏治、军务积习已深，惟在该督实力整顿，力挽颓风，以副委任。将此由六百里谕令知之』。
－－见「大清穆宗毅皇帝实录」卷六十七。
秋七月十二日（丙辰），谕议政王军机大臣等：『徐宗干奏「台湾军务情形」一折，副将曾元福自进扎白沙坑后，设计攻破大岸头各庄竹围，并将大埔、八卦山等处贼巢尽行焚毁，正可乘胜进取；惟吴鸿源以冒暑督战染疫，暂回嘉城。徐宗干因统率乏人，檄令曾元福由间道直趋嘉义接署水师提督；着即饬令曾元福与委署北路协副将汤得升合力致剿，先通南北两路，仍令曾玉明激励官兵、联络义勇，迅克彰城，毋稍迟延。台湾道洪毓琛所出之缺，徐宗干现委知府陈懋烈暂署。惟提督、道员均系署任，现当防剿吃紧之时，骤易统率之人，一切攻取机宜，尤应加意慎重；徐宗干务当实力严催，责令认真剿洗，迅扫贼氛，毋稍松劲。并着左宗棠随时督催，一切军情咨会徐宗干妥筹办理。将此由六百里各谕令知之』。
予福建军营病故道员洪毓琛祭葬、恤荫加等。
－－以上见「大清穆宗毅皇帝实录」卷七十三。
八月初三日（己丑），谕议政王军机大臣等：『左宗棠奏「浙师援江获胜，江西肃清，筹办石太股匪，并台湾、粤勇溃散，请饬林文察办理该处军务，及现办延平、顺昌土匪」各折片，台湾匪徒滋事日久，吴鸿源所统兵勇数已不少，不能于嘉义解围以后迅图攻剿，辄于南靖庄等顿兵数月，致该匪得豫为准备；迨贼守御既坚，又不分兵别觅间道相机雕剿，以至师老财匮、勇丁哗溃，贼氛益肆猖獗，实属调度乖方。业经明降谕旨，将该员革职拏问；仍着左宗棠、徐宗干确切查明，如有别项贻误情形，仍据实奏明参办，毋稍徇隐。林文察即籍隶台湾，熟悉情形；即着该署提督拣调得力将士渡台，联络绅团，速将该处匪徒殄灭。应需饷项，即饬福建藩司于援浙饷内酌量拨给。延平、顺