。以礼部尚书吴炳兼东阁大学士,入阁办事。刘承胤以三千人援桂,自奉上归武冈。三月癸亥,上至武冈,改为奉天府,以氓府为行宫。大清兵攻桂林,焦琏击却之。是时,长沙、常德俱失,何腾蛟与郝永忠等退保衡州;张先璧走宝庆,堵胤锡走永宁卫。忠贞营李赤心等攻荆州,不克,溃入归、巫两江间。马进忠、王有才等遁五溪山中。武冈远在宝庆西,依承胤以为重,承胤遂专恣。六月庚午朔,何腾蛟朝行在;上慰劳再三,锡金币。大学士陈子壮起兵于九江镇;秋七月甲辰,率舟师围广州,不克。命腾蛟督诸镇兵守衡州;未至,衡已破,永忠等南走,腾蛟退保永州。湖南巡抚章旷卒于军。八月己巳朔,以户部侍郎严起恒为东阁大学士。壬午,大清兵破宝庆。刘承胤拒战,败绩,遂降。马吉翔等奉上及两宫斩关出,夜走靖州;商丘伯侯性持兵入卫,由通道县入蛮境,出古泥以达柳州。大学士吴炳扈从不及,死之。九月,李成栋破清远;兵科给事中陈邦彦被执,不屈见害。冬十月,土司覃鸣珂与守道龙文明相攻,遂陷柳州,大掠,矢及上舟。丁丑,上南走象州。兵部尚书张家玉兵败死之。时,大清已定湖南,西入黎平,永州亦破。郝永忠、卢鼎等俱入桂林,何腾蛟与严起恒随至,与留守瞿式耜议分地给诸镇,俾自为守。式耜以督焦琏兵复阳朔及平乐府,陈邦傅亦由滨州复浔州,合兵复梧州。粤西既定,屡请上入桂林。十一月丁酉朔,上回桂林。式耜与严起恒、王化澄并入直,腾蛟督师入全州。大清兵破高州,大学士陈子壮被执不屈,磔死。
戊子,永历二年春丁酉朔,上在桂林。四川巡按御史钱邦芑疏报:四川全省恢定九州岛一百三十余县。上视朝,受贺。封王祥等为侯、伯,升邦芑右佥都御史。癸亥,江西提督金声桓、王得仁以南昌内附。二月,广东总兵李成栋以广东内附。郝永忠溃于兴安。丁亥,入桂林大掠,上夜走南宁。何腾蛟在永宁闻警驰回,与式耜同调诸镇兵入城守御。三月丁巳,大清兵至桂北门,腾蛟等拒战却之。清师闻江西反,遂旋师。声桓使人间道赍佛经,置密疏其中,赴南京输款。以翰林学士朱天麟为东阁大学士。闰三月丙寅朔,皇子慈烜生,大赦,王皇后出也。夏四月乙未朔,遣吏部侍郎吴贞毓、商丘伯侯性敕劳李成栋于广州,封惠国公;并封佟养甲襄平伯。五月,何腾蛟复全州;壬午,复宝庆府。六月甲午朔,驾幸浔州。封陈邦傅庆国公。秋七月甲子朔,次梧州,谒兴陵。成栋请上移驻广东,使其将罗成耀将甲士五千迎驾;瞿式耜请回桂林。众议肇庆监国之地,居两省中,遂移居焉。八月癸巳朔,驾幸肇庆。拜成栋翌明大将军,以其子李元胤为锦衣卫指挥,使掌丝纶房事。袁彭年为左都御吏;彭年以广东布政使与成栋密谋内附者也。朱容藩僣称监国于夔州,督师吕大器命川将李占春诛之。九月,召旧辅何吾驺、黄士俊入阁。冬十月,何腾蛟攻永州、衡州,克之。李成栋命其子元胤以兵三千宿卫,遂为禁旅。是时,江西、广东俱复,惟赣州为高进库所守,金声桓使王得仁攻之不能克;命成栋率师助之。比成栋至,而大清兵已抵南昌;得仁还救,成栋战不利,退屯南康。十一月,杀佟养甲。李赤心破清将线国安于湘潭,遂复益阳、湘潭、湘乡、衡山等县;堵胤锡围长沙。十二月辛卯朔,封李元胤南阳伯、马吉翔文安侯。大清兵至长沙,诸将溃,腾蛟退保湘潭。
己丑,永历三年春正月庚寅朔,上在肇庆。壬申,朱天麟罢。戊寅,南昌破,金声桓、王得仁皆死。二月庚寅朔,湘潭破,马进忠败走,何腾蛟被执不屈死之。李成栋亦败于信丰,渡河堕水死。事闻,赠腾蛟湘中王、成栋宁夏王、声桓南昌王,设坛祭之。以杜永和为两广总督,驻广州;罗成耀守南雄。忠贞营之众,亦溃于茶陵,由道州入粤西。堵胤锡以胡一青、赵印选兵守衡州。三月,大清兵至,胤锡走道州;衡、永二府俱不守。四月,孙可望疏请封王,廷议不可。孙可望自丁亥春入滇,据全省,称国主,以干支纪年。其党李定国等抗不相下,云南监军杨畏知诱之来归,请封,久不决。武康伯胡执恭驻思恩,便宜矫册印入滇封可望为秦王;而肇庆不知也。六月己丑朔,堵胤锡至肇庆,加文渊阁大学士,封光化伯,使召李赤心等出楚。七月,封可望为平辽王,赐名朝宗。刘文秀、李定国、艾能奇等皆为公。可望却不受。冬十月癸丑,马进忠、王进才克武冈。乙卯,克宝庆、靖州。何吾驺、王化澄罢。封黔镇皮熊为黔国公、播镇王祥为忠国公,防滇也。十一月辛巳,督师大学士堵胤锡卒于浔州,赠镇国公。十二月戊申,以史馆乏员,上亲试士,取刘■〈艹洍〉、钱秉镫、杨在、李来、吴龙桢、姚子庄、涂弘猷、杨致和八人,俱授庶吉士。大清兵入粤,罗成耀自南雄遁回。
庚寅,永历四年春正月乙卯朔,上在肇庆。己未,闻庾关不守,问备御之策,无对者。辛酉,上登舟。戊辰,韶州复破。辛未,上西幸。命戎政尚书刘远生、给事中金堡宣谕广州诸将,令杜永和出师。留马吉翔、李元胤居守。庚辰,上至梧州,驻舟江干。内阁黄士俊以疾归,召朱天麟入直。二月,大兵至广州,围之;调陈邦傅、高必正等东援。丁亥,户部尚书吴贞毓等合疏论袁彭年、金堡、丁时