有自下引之者，倏然而没，固已骇之矣。时方白昼，有黑云如扇起，顷之蔽空，对面不相识。徐徐睹一物起潭中，类莲花，茎柄皆赤色。继而双眼如日，耀采射人，突起其上。诸僧惊怪，急奔下山，雷雨已随其后，移时乃止。其龙汋亭及诗记，今不复见。” (上载在县志)
巨蟒神踪
《晋安逸志》云：“唐僖宗时，山有巨蟒为祟。邑人刘孙礼妹三娘，姿色妖艳，蟒摄入洞中为妻。孙礼不胜忿恚，誓必死之。遂弃家远游，得遇异人，授以驱雷秘法，归与蟒斗。是时其妹已生十一子，孙礼杀其八。妹奔出再拜，为蟒请命，孙礼乃止。后三子为神，曰九使，十使，十一使。闽中往往立庙祀之。”今吉祥峰下亦有九使神宫。
五音鳄石
状似鳄鱼，叩有五音。后值倭变，物不复存焉。
九龙古树
距寺数百武，植于甬道之右，即木桥下溪边也。唐广明间，巢寇入山，鸿休师遇害于此。事著前篇。其树约高八九丈，婉蜒屈曲，执若虬龙。下垂九根于地，突兀苍古，因号为九龙树。今废。
郑渚金声
黄檗郑渚田详前。嘉靖末，其田后陷为咸卤，尽落民间。后乡民辄修辄坏。夜间坏处往往有金鼓震击之声，疑是本山伽蓝所司。
嵩岩香乳
沸座有嵩头陀岩，出乳香于石罅闾，以手指捏之，香经日不散。
祥云现瑞
万历戊申岁九日，庆云现于黄檗佛座峰。林大启诗有“疑成五彩诸天丽”之句。甲寅秋夜，复现于山之西，烂熳如锦，观者不知何祥。数日后，闻请藏经命下矣。林伯春作《祥云歌》志喜。歌日：“云何祥兮，缦西方兮。瑞征龙藏，宠锡将兮。山寺荒凉，喜生光兮。佛日辉煌，永劫长兮。”又曰：“彩云烂兮横檗山，绚日光兮影尘寰。明君贤相之所关，太史瞻之动圣颜，魏公勋业满人间。”
戊子季夏望日，师与客会拱桥，忽然天际流辉，仰而观之，五彩文明。谓客曰：“此卿云也。斯日嘉会，天有瑞气之兆，异时必有祯祥之应。”因作歌志之曰：“阴阳调和兮瑞物生，师资契会兮学业成。中外一如兮禅林振，主宾唱和兮大道行。庆云烂熳兮瑞气之所钟，佛日长悬兮吾皇之德明。”
春畦法雨
崇祯庚午季春廿七日，农民方以旱魃为虐，田龟水涸，焦逼无奈。适密云和尚飞锡南来，到黎湾，黑云忽起，大雨随至，田得耕抻，远近共庆，咸传为法雨云。卓冠诗有“妙云欲覆涅槃海，法雨先滋热恼田”之句。
彩泥示现
壬午仲夏，塑大佛将毕，欲上细泥，遍寻鸟有。一日，骤雨狂发，奔流异常。午后雨止，师溯流览胜，至藏角小涧处，祥光映日。细观五彩之泥，莹润可爱，碾如粉末，令佛师取之，上三尊讫，其泥隐矣。大众汉奇。师曰：“佛之福缘，不可思议，何奇之有？”嘱侍者记之，以晓将来。
白光贯顶
壬午腊旦，大佛功成。佛师万象先自入闽中，以此功德大获如意，遂受菩萨圆满大戒。朝昏竭诚，如法修忏。至第八早，入眦卢阁中，忽见大殿顶上白毫光圆如盖，逾时乃散。自庆弗胜，入室白师。师曰：“此是诚心所致，感应道交，白业已成，戒法圆满，吾为汝喜，益见佛不汝欺也。”
隐祖灵迹
隐元祖师，顺治甲午十一年，日本国主请行化彼处。番舶启行，风浪大作，祖书“免参”二字贴船首，此浪遂平。时有巨鳞数万，护舟出洋而散。舟夜抵其国，海外渔人，咸见岸上红光亘天，以为失火，各操船来援，及将近，光隐矣，始知祖之瑞光发现也。远州信官尝奉祖手书观音佛号，偶遇回禄，舍宅俱尽，独祖笔迹如故，特来礼觐。祖示以偈，有“真名火不烧”之句。雍正初年，日本大疫流行，获祖真迹悬于中堂则无恙。国主绘像于宫中供祀。
黄檗山寺志
●目录
续修黄檗山志序
黄檗重修寺志序
黄檗山续志序
黄檗山寺志序
黄檗寺志序
黄檗山寺志序
黄檗山志凡例八则
卷一
山十二则
峰十十五
石
岭
垅
池
溪三
井三
泉三
卷二
寺
殿
堂
阁楼
廊
寮
房
三门
亭
桥
坝
碾
碓
磨
台
庵
院
塘
庄
坞
田
园
卷三
僧
唐
后唐
明
卷四
法
卷五
塔三十七座
卷六
外护序启
序十九则
启九则
卷七
记一则
赋二则
赞十六则
居士