控之案者，无论系本人子孙及转售他人，均令照旧管业外，若有侵占民、番地界之处，秉公清查，民产归民、番地归番。不许仍前朦混，以启争端。此后，台郡大小武员创立庄产、开垦草地之处，永行禁止。倘有托名开垦者，将本官交部严加议处，地亩入官；该管官通同容隐，并行议处』。
定例：总兵官三年俸满，请旨陛见；副将三年限满，给咨引见；参将、游击、都司、守备二年限满，咨部推补；干总、把总三年限满，赴省候文推补。其兵丁，由内地三年按班抽换，不准就地推补。又新例：武职四十无子者，亦准搬眷，与文职同。
雍正十一年，总督郝玉鳞奏准：台属民壮俱系无赖流寓之人，每多滋事，扰害良民。除原拨澎湖通判、台湾府经历、台凤诸彰四系典史民壮共四十四名照旧存留供役外，其道、府、同知、知县共民壮三百五十六名，悉行革退，编入保甲。将原给器械，追缴贮官。即于镇标营兵内酌量拨给道员二十四名、知府二十名、台同知十五名、淡同知二十四名、台凤诸彰四县各二十名，以资护卫巡查。
乾隆三年奏准：嗣后台地如有民人不法等事，许令武员移送地方官究治；如兵丁生事滋扰，许文员关会营伍责惩。如有彼此推诿者，照例罚俸一年。并饬令各该地方官、汛防员弁实力奉行，彼此按月稽查，取具并无兵民滋扰印结，转报该上司查核。如或有意徇纵，将该地方官照徇庇例议处。
前此覆辙，患在兵虚将惰。而虚兵之原，皆由台地招兵换名顶替。盖兵从内地抽拨，逃亡事故不为申报，每至放饷，即留饷以饱私橐；即有召募，强半市井亡赖，空名挂籍，含混欺朦，则主帅、大府之过也。当责总兵不时清厘，使随丁悉照定制，空粮悉行拨补。无籍之人，一名不得妄招；到伍之兵，一名不得顶替：则虚冒之弊可除。兵既充伍，而训练尤所当亟讲者。拨换入班，即宜配明队伍，将统弁、弁统队、队统卒；清查器械，不足者补之、不精良者淬砺之，按期操演。各营将操期并演何技勇逐月汇报，务使兵与将习、手与器习而后可。而分汛又当斟酌变通：台地辽阔，大汛驻兵一、二百名或数十名，究之官多离汛、兵多聚赌，有汛防之名、无守望之实，多兵亦奚益乎？防汛分作几处、匀作几班？统以该汛弁目于本汛乡庄、市镇、山口、港隘分地划界，巡哨侦探；有事则飞报本营酌量调遣追捕，无事则远者一月一换、近者半月一换。歇班之兵，归营操练。更番戍守，人无偏劳，声息可以时通；庶卖汛旧弊，自此绝矣。巡哨海口，责之水师。远近岛屿，必明港澳险易、业杂交错之区；上下风涛，必察湾泊向背、取水候风之所。善其舟楫械器、习其行阵击刺，定其游巡往来，毋潜伏内港，空文申报；驾驶既熟，乘风自易。则整练平时，可资备御；出师剿捕，可成劲旅。宁有兵虚、将惰之患哉（「赤嵌笔谈」）？
万历二十年，倭犯朝鲜。二十五年，增设澎湖游兵。四十五年，倭犯龙门港，增冲锋游兵。其地环衍可二百余里，地斥卤、水咸涩，常燠多风，稼樯差艰。峙正中者，曰娘宫屿。从西屿入，二十里为茶盘，又十里即娘宫屿矣。波平浪息，无淜奔激射之势。其状如湖，因曰澎湖；宽可泊船。面为案山、右为西安，各置小城；列铳为守，名曰铳城。又左为风柜山，高七、八尺；红毛凹其中，上垒土若雉堞。今毁其城，仍分军戍守，与案山、西安相犄角。东为莳上澳、猪母落水，最当南之冲；由陆趋娘宫，三十余里。旧有舟师戍守，今更筑铳城以防横突。又东南向，为锁管港、林投仔、龙门、青螺诸澳。龙门有原泉，旧为居民聚落。万历三十五年，倭突犯，泊此屿。西为西屿头；有果叶澳，泉甚冽可饮。稍北，为竹篙湾。又西，为■〈虫咠〉仔湾。又西北，为丁字门、水吼门，今皆有兵戍守。屿北，为北山墩。又北太武稍卑，为赤嵌。循港而进，为镇海港；垒城于此。又西北，为吉贝屿。又北太武与中墩，称两太武；俱最高，便于瞭望。娘宫稍后二里有稳澳山；颇平坦。自万历三十七年，红毛一舟阑入澎湖，久之乃去；天启二年，高文律乘戍兵单弱，以十余船突掳澎岛。遂因山为城、环海为池，破浪长驱，肆毒漳、泉。总兵俞咨皋移红毛于北港（即台湾），乃复澎湖。议于稳澳山开筑城基，大石垒砌，高丈有七、厚丈有八，东西南留三门、北设铳台一座；内盖衙宇营房，凿井一口。戍守于此，以控制娘宫（「方舆纪要」）。
澎湖出洋巡哨，由妈宫澳开驾，向西至西屿头，经内堑、外堑，复收泊西屿头内大果叶登岸。大果叶二里，左为缉马湾、右为小果叶。南四里，至内堑。按季轮拨千、把各一员；澳口炮台一、东山顶烽台三。内堑西南三里，左为堑澳口；炮台一、西山顶烽台三。再北，经缉马湾、小果叶，八里至小池角。西北四里，至大池角；十五里，至小门。炮台一、烽台一。四里，至鸽界头横礁；三里，至竹篙湾，仍回至大果叶。十里，登舟，由内港驾至北山瓦硐港寄泊。登岸四里，至通梁；三里，至后寮；二里，至大北山。山顶瞭望，北为吉贝屿、姑婆屿、土地公屿、铁砧屿、目屿、白沙仔屿、险礁，东为湾目屿蓝笨仔屿