舞止。引赞赞：『跪；叩首……（正献、分献、陪祭各官俱行三跪九叩礼）；兴，平身』。麾生偃麾（如前仪）。通赞唱：『读祝者捧祝、司帛者捧帛，各诣瘗所』。正祝由中门、左右配哲由左右门、两庑各随班，俱诣瘗所。通赞唱：『诣望瘗位』。各献官诣瘗位。麾生举麾，唱：『乐奏咸平之章』。有乐、无舞（乐章同送神）。通赞唱：『望瘗』；唱：『焚祝、帛』；唱：『复位』。麾生偃麾，乐止。通赞、引赞同唱：『礼毕』。各官俱退。
文庙祭毕，乃祭朱文公祠，帛一、羊一、豕一、簠一、簋一、笾四、豆四。次祭名宦祠、次祭乡贤祠，品物俱同（台「乡贤」尚缺）。朱文公祠主祭官，台湾府知府或委员。其盥、瘗、奠献，俱如仪；迎神、送神，俱一跪三叩（乾隆十年议准：每逢朔望，直省文武大员于文庙行香后，即亲诣崇圣祠行礼。或有事，则委教官代）。
文庙神主位次：正殿：至圣先师孔子神位，正中南向。四配：复圣颜子、述圣子思子，在殿内东傍，西向；宗圣曾子、亚圣孟子，在殿内西傍，东向。十二哲：先贤闵子（名损）、先贤冉子（名雍）、先贤端木子（名赐）、先贤仲子（名由）、先贤卜子（名商）、先贤有子（名若。乾隆三年，自东庑升），在殿内次东，西向；先贤冉子（名耕）、先贤宰子（名予）、先贤冉子（名求）、先贤言子（名偃）、先肾颛孙子（名师）、先贤朱子（名熹。康熙五十一年自西庑升），在殿内次西，东向。东庑：先贤蘧瑗、先贤澹台灭明、先贤原宪、先贤南宫适、先贤商瞿、先贤漆雕开、先贤司马耕、先贤梁鳣、先贤冉孺、先贤伯虔、先贤冉季、先贤漆雕徒父、先贤漆雕哆、先贤公西赤、先贤任不齐、先贤公良孺、先贤公肩定、先贤邾鄡、先贤罕父黑、先贤荣旗、先贤左人郢、先贤郑国、先贤原亢、先贤廉洁、先贤叔仲会、先贤公西舆如、先贤邽巽、先贤陈亢、先贤琴张、先贤步叔乘、先贤秦非、先贤颜哙、先贤颜何、先贤县亶、先贤乐正克、先贤万章、先贤周敦颐、先贤程颢、先贤邵雍、先儒谷梁赤、先儒伏胜、先儒后会、先儒董仲舒、先儒杜子春、先儒范宁、先儒韩愈、先儒范仲淹、先儒胡瑗、先儒杨时、先儒罗从彦、先儒李侗、先儒张栻、先儒黄干、先儒真德秀、先儒何基、先儒赵复、先儒吴澄、先儒许谦、先儒王守仁、先儒薛瑄、先儒罗钦顺、先儒陆陇其（东庑共六十二位）。西庑：先贤林放、先贤宓不齐、先贤公冶长、先贤公哲哀、先贤高柴、先贤樊须、先贤商泽、先贤巫马施、先贤颜辛、先贤曹恤、先贤公孙龙、先贤秦商、先贤颜高、先贤壤驷赤、先贤石作蜀、先贤公夏首、先贤后处、先贤奚容蒧、先贤颜祖、先贤句井疆、先贤秦祖、先贤县成、先贤公祖句兹、先贤燕伋、先贤乐欬、先贤狄黑、先贤孔忠、先贤公西蒧、先贤颜之仆、先贤施之常、先贤申枨、先贤左邱明、先贤秦冉、先贤牧皮、先贤公都子、先贤公孙丑、先贤张载、先贤程颐、先儒公羊高、先儒孔安国、先儒毛苌、先儒高堂生、先儒郑康成、先儒诸葛亮、先儒王通、先儒司马光、先儒欧阳修、先儒胡安国、先儒尹焞、先儒吕祖谦、先儒蔡沈、先儒陆九渊、先儒陈淳、先儒魏了翁、先儒王柏、先儒许衡、先儒金履祥、先儒陈澔、先儒陈献章、先儒胡居仁、先儒蔡清（西庑共六十一位）。
崇圣祠神主位次：正殿：肇圣王木金父公、裕圣王祈父公、诒圣王防叔公、昌圣王伯夏公、启圣王叔梁公。东配：先贤颜无繇、先贤孔伯鱼、先儒周辅成、先儒程珦。西配：先贤曾晰、先贤孟孙激公宜、先儒朱松、先儒张迪、先儒蔡元定。
书院
海东书院：在府学西。康熙五十九年，巡道梁文瑄建；后为岁、科考棚。乾隆四年，督学单德谟奏请别建考院。五年，督学杨二酉奏准照直省书院例，以府学教授为师，选诸生肄业其中。贡生施士安捐田一千亩充膏火。题额曰「海天云汉」（有记载「艺文）。
台湾道刘良璧海东书院学规
书院之设，原以兴贤育才。台地僻处海表，数十年来沐我圣天子涵濡教养之恩，人文蔚起，不殊内地。今提学杨公奏请特立书院，延请师儒，端为生童肄业；俾成人有德，小子有造。所有规条如左，愿诸生遵守勿违。
一、明大义。圣贤立教，不外纲常；而「君臣」之义，为达道之首，所以扶持宇宙为尤重。台地僻处海表，自收入版图以来，秀者习诗书、朴者勤稼穑。而读书之士知尊君亲上，则能谨守法度、体国奉公，醇儒名臣由此以出。虽田夫野老，有所观感兴起；海外顽梗之风，何至复萌？
一、端学则。程、董二先生云：『凡学于此者，必严朔望之仪、谨晨昏之令，居处必恭、步立必正、视听必端、言语必谨、容貌必庄、衣冠必整；饮食必节、出入必省；读书必专一、写字必楷敬；几案必整齐、堂室必洁净；相呼必以齿、接见必有定；修业有余功、游艺有适性；使人庄以恕，而必专所听』。此白鹿书院教条与鳌峰书院学规并刊，工夫最为切近。
一、务实学。古之大儒，明体达用、成己成物，皆由为诸生时明