乘势纵击败之，然城中亦力竭矣。礻卑将刘养鲲言有诸生范祖文、邹尉陷贼中，遣孔之谭来约。贼将罗干象欲自拔效用，燮元即遣之谭复往，至则与干象俱来。燮元方卧戍楼，呼与饮，干象衷甲佩刀，燮元不之疑，就榻呼同卧，酣寝达旦。干象感激，誓以死报，许之，缒而出，后贼营举动，纤悉无不知者，干象之力也。俞数日，又使牙将周斯盛诈降，质其来，设伏待之。崇明果自至。甫悬一人上，松潘守兵不知，大噪。崇明走，伏起，获其从骑数人。崇明跳身免，乃谋远遁。燮元侦知，造水牌数百面，投锦江顺流而下，令有司沉舟斩筏，断桥梁，严兵以待。贼夜半果逸，干象等内变，贼营四面火起。崇明父子拔营走，干象等皆来归。成都围凡百有二日而解。贼渡泸归重庆。事闻，以燮元为巡抚。
三月，罗干象复江安。四月，官兵复新都。初，奢贼据新都，缮城积粟为守计，因克安岳，攻保宁，声言直取潼关，人心震动，安绵副使刘芬谦、湖广监军杨述程合兵攻之。兵至牛头镇，贼以骑数千、步万人来援。秦良玉、谭大孝等夹击败之，遂复新都。贼退入兰州，复遵义府。时有湄潭叛民王伦引贼焚掠。湄潭为川、贵险要。都司陈一龙追至水西境，降之。诸军进驻遵义。时惟重庆尚为贼巢。
五月，诸军进逼重庆。初，奢崇明父子据泸、，倚樊龙为声援，龙盘踞重庆，已九阅月。重庆，古渝州地也，三面临江，春水泛涨，一望弥漫不可渡。其出入必经之要道，惟佛图关至二郎关一路。贼自通远门城濠至二郎关，连营十有七，宿精兵数万。监军副使丘志充、杨述程，总兵杜文焕帅兵进攻之，再战，几入其垒。翌日，文焕帅参将杨克顺等直抵贼营，石主宣抚官秦民屏率部兵绕出其后，贼惊败，遂连复佛图、二郎二关，杀贼三千余人，积尸深沟，两岸俱平，乘胜进逼重庆。二十七日，以计擒贼首樊龙、张彤、何若海等三十一人，遂克之。六月，川师复泸州。七月，遵义复陷。
贵州水西土目安邦彦叛。邦彦，安尧臣别枝也。安尧臣冒陇姓，并陇地，受抚，得袭兄强臣世职。尧臣死，妻奢社辉、子安位幼，邦彦挟之反。时四十八马头与头目安邦俊、鲁连、安若山、陈其愚、陈万典等，蜂起和之。都司杨明廷以三千人败没于毕节。参将尹启易等自乌撒奔回沾益，炎方、松林皆不守，平夷卫亦为贼党李贤所破。贼围普安、安南。云南都司李天常帅兵四千救之。贼将罗应奎伪降，诱至迭水铺，伏发，全军皆没。于是交水、曲靖、武定、寻甸、嵩明之间，骚然苦兵矣。贼分遣王伦、石胜俸下瓮安，袭偏、沅以断我军。伦等，杨应龙余孽也。洪边土司宋万化纠苗仲九股，据龙里，邦彦自统蜀贼苗仲数万，进围贵州。自二月初九日薄城下，造云梯，制滚厢，筑墩台，百计攻城。抚臣李、按臣史永安悉力御之。贼沿山札营，四面伏路把截，以断城中出入，尽掘环城坟墓，杀掠甚惨。置木栅垒户墙，鸟雀不能飞渡。镇将张彦芳将兵二万赴援，隔龙里不得进。贵州总兵杨愈懋、推官郭象仪与贼战于江门白杵营，死之。
安邦彦破乌撒卫，指挥管良相死之。先是，水西未叛，良相与李曰：“奢氏反，安必继之。黔中无兵饷，猝然有变，计将安出？宜招兵万人，积二年[QDXD]，用许成名将之，以观其变。”以力不能，止。后良相以祖母病乞假去，泣而曰：“乌撒孤城，且与安效良相仇，水西有难，祸必首及。良相只身无子，愿以死报国。乞图长策，保此一方。”亦泣。良相去，甫一月而难起。乌撒首被贼破，良相自缢死。
巡抚都御史王三善进兵平越。时平越所陈兵止万余人，副总兵徐时逢、参将范仲仁不相能。仲仁先进，遇贼于瓮城河，战不利，时逢拥兵不救，遂大败，诸将马一龙、白自强等歼焉。各处声援俱绝，贵阳围益困。城东隅有山冈，与城齐，贼踞其上，作厢楼，官兵设计烧之，火三昼夜不绝。城中粮久乏，将士病不能战。巡按史永安上疏诋王三善，大声疾呼。十一月，三善大会将士议曰：“省城不能待矣！外援不至，吾辈死法、死敌，等死耳，尚何俟耶！”命道臣何天麟督兵七千从清水江进，为右部；道臣杨世赏督兵万人，从都匀进，为左部；三善自将二万，与道臣向日升从中路进，当贼锋。十二月抵新添，衔枚疾走，二日，进母猪洞。三日，次新安。是夜，贼报至，营中惊扰，议退兵。三善曰：“退即齑粉，以死捍之！”按兵不动，卒无贼。四日，命刘超为前部，抵龙头营。三善以身尾之，相去不二里，闻铳声，众股栗欲止。三善曰：“前驱当贼，必无退者，吾当为后劲。”遂策马而前，未一里，刘超捷音至。超兵遇先却，超下马斩二人，持刀断贼一标。贼首阿成骁勇善战，超与部兵张良俊直前斩其首，贼遂披靡。适大兵至，大呼齐进，夺龙里。贼众复大集，大战却之。五日，住龙里城，众议去省会不远，贼必重兵堵截，宜少休息。三善曰：“我兵猝至，贼无备，不能持久，急击之勿失！”六日，遂策马先进，众随之。贼觇者，亦知新抚自将，意有数十万兵至，相顾骇愕。安邦彦绐其众曰：“吾当增兵来助！”遂遁去。贼相率退屯龙洞，我师夺高寨、七里冲，乘胜进兵毕节铺。贼步骑如云，孙元谟将所制木发