地公崎、阿猴林一路,守备李燕、蔡勇由卓猴、木冈社一路。已亥午刻,咸会罗汉内门之中埔庄。别遣把总林三、陈云奇、郑荣才、游宽往大武垄,分路堵截,无令贼窜。庚子,分兵深入搜捕。罗汉内门诸将备,分搜银锭山、佳白寮、东方木、南马仙等处。大武垄诸弁目搜礁巴哖、郎包米、大龟佛、大湖等处。穷山密箐,无不遍历,焚毁贼窼数十所。凡二十七日,乃收军回营。据搜山将备及差员外委苏思维、陈祥、李得胜、林福、石瑀、蓝敦等先后报获■〈艹〈束刂〉〉 瓜成(即陈成)、林阿尾、林丁、庄谋、林读、林齐、郑教、陈璞等。而石壁寮再叛诸孽,尽行廓清矣。又据报获郑文苑、林沙掌、凶死郡(即陈国进)、戆昆(即林昆)、■〈氵〈厂外〈亻鸟〉内〉〉仔吴(即李吴)、洪迎、胡君用等,及台厦道陶范获解萧斌、麻恩、金丝猴(即林玉)等。而朱一贵案内附和倡乱诸贼,悉数俘囚,惟王忠、邱宝宣未获,遁逃傀儡内山、台湾山后。蓝廷珍分遣外委弁目,诸路访缉。复令外委郑国佐、林天成召致山番通事章旺,同入傀儡内山,遍查各社,谕番众嗣后不许窝留。复令郑国佐往郎娇,绕行山后,至卑南觅,传檄奖谕大土官文结,以官带补服赏劳之,令起崇爻七十余社壮番,从山后大加搜捕,将所有汉人逸贼尽缚以来。于是王忠等不敢复入番界,只身窜伏,束手待毙矣。
前此台变逃回道府厅县各文员,朝旨令督臣、提臣会审,发往台湾正法,并已故知府王珍尸棺剖枭示众。武赋周应龙等,亦令督臣会同提臣严审定拟。署提督尚未班师,十有二月,总督满保在厦亲审诸文员,将原任台厦道梁文煊、同知王礼、知县吴观域、朱夔、知府王珍尸柩、委海澄营游击安奎,赍令箭押送之台,十月八日甲戌决于市。而台湾县丞冯迪、典史王定国、诸罗县典史张青远,俱羁台湾县狱候部文秋后处决。
广东提督姚堂奉旨调任福建水师提督,署提督蓝廷珍遣游击王良骏赍印赴厦,克期班师。总督满保以地方初定,檄廷珍以南澳镇仍统征兵,暂留在台弹压。
时廷议台镇总兵官移设澎湖,台湾府治设陆地副将,裁去水陆两中营,将备弁兵撤归内地另补。民间忧惶,不安寝食,宵小之徒,讹言复肆。康熙六十有一年春正月,差员陈祥、王仁和续获韩渊、林良等。蓝廷珍念讹言摇惑,会商陶范、高铎、孙鲁,以逆贼苏清等多人在狱,久留未决,恐不足震慑奸顽。二月二十有九日甲申,将苏清、林阿尾、王教、林读、林丁、庄谋、林昆、韩渊、林良诸贼枭斩示众。李吴杖死。杨美先一日病死。陈成、郑文苑等剧贼十数人,及续获之邱宝宣、江邦俊,悉解内地,与黄殿等俱禁省狱。候审拟归案正法。
朝廷以台疆僻处天外,民间疾苦,无由上达,特命满汉御史各一员,岁奉差到台巡视。以南澳镇总兵官蓝廷珍调镇澎湖。总督满保疏荐督标中军副将徐左柱调补台湾陆路副将。
三月望日庚子,南路下淡水奸民林亨等复谋作乱,以「合心王」三字为勘合,颁于其党。方贸帛制旗,欲夜举事,有密报者,守备陈一得率官兵捕之,擒林亨,搜得勘合及伪札,供称同谋为首颜烟、李咸、陈法、王帅、王禄等,分遣弁兵围搜大昆麓罟寮及北路铁线桥诸处,并获之。复有余孽百余人遁入诸罗后山小石门、得宝寮等处,夜出行劫。蓝廷珍密檄北路参将朱文、协防游击林秀发兵搜捕。遣署守备李郡、把总郑高、林时叶分三路并进,复遣把总庄子俊、苏思惟率兵往大武垄堵截,绝其窜路。夏四月戊午,诸军齐集会剿,贼已先一夜遁至三林港,焚汛,杀伤兵丁,夺商贩小船二,入海逃生。蓝廷珍飞遣水师将弁出洋追捕。闻报,在内地青水墘刦坐商船,至铜山洋面又夺坐小渔船;料为潮贼,将散伙登岸,必于樟林、东陇、鸿沟、澄海等处。在三林多有带伤,又从朱一贵作乱时皆割截发辫,易于稽察。星夜飞请总督满保、巡抚吕犹龙移檄粤东,令潮州镇、道、府、县密行查缉。仍差千总一员赴潮催提。尽获刘国华、邱阿路、张阿舜、赖日辉、林阿元、胡阿发、黄阿赤、黄阿五、巫阿盛、陈阿日等贼党五十七人,皆解闽审讯监候正法。
癸亥夜,又有奸匪百余人在八掌溪、小溪洲拜旗作孽,行至竹仔脚塘,杀塘兵陈楠、王亘、苏天贵等三名,比晓皆散,回家为民。廷珍飞调将弁,上下堵截搜捕,寂无踪迹。差员四路密访,并令营县广差侦探。知县汪绅文缉获叶枕、廖猛、赖兴、赖勤等,供指同谋聚众群贼。因遣兵搜捕北埔寮诸山。千总李郡生擒渠魁李庆,夺贼旗械,及所劫赃物,焚毁窼庐。又据参将朱文、知县汪绅文、守备刘锡、千总何勉、陈章、把总陈云奇及外委弁目人等,先后缉获黄潜、苏齐、张成、李延卿、张乌畅、潮边、王妙、何岁、张镇、朱昆生等剧贼四十余人,俱解内地,收禁福州府狱,候审拟分别正法。
五月,署台湾府同知兼摄台湾知县事孙鲁调补诸罗县知县。钦差巡台御史吴达礼、黄叔璥至自京师。六月,新授台厦道陈大辇、台湾府同知杨毓健、员外郎知台湾县事周锺瑄及副将徐左柱等,俱先后抵台视事。
有奸民郑仕者,绰号急烧疏,复讹言惑众,招集亡命,谋于六月乙卯夜竖旗,不果。蓝廷珍捕治之,得其党萧兴祖、李柯