【旧二员、后革一员、万历九年尽革、十一年、復设一员】蕃育署
署丞一员 【旧二员】
录事一员 【旧二员、后革一员、万历九年尽革、十一年、復设一员、旧有典署一员、隆庆元年革】林衡署
典署一员 【久住补】
署丞一员 【旧二员旧有录事二员、后革】嘉蔬署
署丞一员 【旧二员旧有典署、录事、各一员、嘉靖三十一年革】中、左、右、前、后、五军都督府经歷司经歷各一员 都事各一员
断事司 【后革。旧有断事官一员、左右断事官二员、提控案牘二员、司务二员、司狱一员、中左右前后五司、稽仁、稽义、稽礼、稽智、稽信、各一员、后俱革】锦衣卫经歷司
经歷一员
各卫经歷司
经歷各一员 【共七十三员、旧各有知事一员、革、济州等五卫、各添收粮经歷一员、万历九年革】仓副使各一员 【旧有大使各一员、后革】京卫武学
教授一员
训导四员 【旧六员】
留守中等卫各门千户所 【旧有吏目各一员、后革】牧马千户所
吏目一员
蕃牧千户所
吏目一员
奠靖千户所
吏目一员
中、东、西、南、北、五城兵马指挥司 【惟中城止称中兵马指挥司】正官
指挥各一员
副指挥各四员 【旧各四员、后增至六员、嘉靖三十六年、五司各革一员、隆庆三年、五司各革一员、今各设四员】首领官
吏目各一员
僧录司
左右善世二员 左右阐教二员
左右讲经二员
左右觉义二员 【俱不支俸】
道录司
左右正一二员 左右演法二员
左右至灵二员
左右玄义二员 【俱不支俸】
神乐观
提点一员 知观二员
大明会典卷之三
【官制二】
【南京官】
南京官裁减不一、今止书其见设者
南京宗人府
经歷一员
南京吏部
尚书一员
右侍郎一员 【万历三年革、十一年復设】司务一员
文选清吏司郎中一员 主事一员
验封清吏司郎中一员 【旧有主事一员、隆庆四年革】稽勋清吏司郎中一员 【旧有主事一员、后革】考功清吏司郎中一员 主事一员
南京户部
尚书一员
右侍郎一员 【嘉靖二十六年、革南京粮储都御史、以本部侍郎督理粮储】司务一员
照磨所
照磨一员
浙江清吏司郎中一员 员外郎一员
主事一员
江西清吏司郎中一员
员外郎一员 【隆庆四年革、万历十一年復设】主事二员 【旧一员】
福建清吏司郎中一员 员外郎一员
主事一员
湖广清吏司郎中一员
员外郎一员 【万历九年革、十一年復设】主事一员
广东清吏司郎中一员 员外郎一员
主事一员 【旧二员、内一员管黄册、隆庆三年革一员】广西清吏司郎中一员 【旧有员外郎一员、隆庆三年革】主事二员 【内一员管黄册】
河南清吏司郎中一员 主事一员
山东清吏司郎中一员 主事一员
山西清吏司郎中一员 【旧有员外郎一员、嘉靖三十七年革】主事二员 【内万历九年革一员、十一年復设】陕西清吏司郎中一员 【旧有员外郎一员、嘉靖三十七年革】主事一员
四川清吏司郎中一员 主事一员
云南清吏司郎中一员 【旧有员外郎一员、隆庆四年革】主事二员 【内万历九年革一员、十一年復设】贵州清吏司郎中一员 主事一员
所属衙门
宝钞提举司 【旧有提举一员、隆庆三年革、归併九库大使兼管】广积库
大使一员
承运库
大使一员
赃罚库
大使一员
甲、乙、丙、丁、戊字库
大使各一员
宝钞广惠库
大使一员
军储仓 【旧有大使一员、隆庆三年革】长安门仓
副使一员
东安、西安、北安门仓 【旧有副使各一员、隆庆三年革】龙江盐仓检校批验所
大使一员
南京礼部
尚书一员
右侍郎一员 【万历三年革、十一年復设】司务一员
仪制清吏司郎中一员
主事一员 【隆庆四年革、万历十一年復设】祠祭清吏司郎中一员
主事一员 【万历九年革、十一年復设】主客清吏司郎中一员
精膳清吏司郎中一员
所属衙门
行人司
左司副一员
铸印局
副使一员
教坊司
右韶舞一员 左右司乐各一员
南京兵部
尚书一员
右侍郎一员 【万历三年革、十一年復设】司务一员
武选清吏司郎中一员 主事一员
职方清吏司郎中一员 员外郎一员主事一员
车驾清吏司郎中一员 员外郎一员主事二员
武库清吏司郎中一员 主事一员
所属衙门
典牧所
提领一员
会同馆
大使一员
大胜关
大使一员
南京刑部
尚书一员
右侍郎一员 【万历三年革、十一年復设】司务一员
照磨所
照磨一员
浙江清吏司郎中一员 【旧有员外郎一员、隆庆三年革】主事一员
左旋